Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Syt1P46096 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Syt1P46096 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Syt1P46096 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Syt1P46096 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Syt1P46096 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Syt1P46096 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Syt1P46096 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Syt1P46096 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Syt1P46096 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Syt1P46096 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Syt1P46096 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Syt1P46096 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Syt1P46096 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Syt1P46096 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Syt1P46096 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Syt1P46096 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Syt1P46096 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Syt1P46096 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Syt1P46096 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Syt1P46096 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Syt1P46096 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Syt1P46096 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Syt1P46096 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Syt1P46096 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Syt1P46096 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Syt1P46096 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Syt1P46096 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Syt1P46096 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Syt1P46096 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Syt1P46096 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Syt1P46096 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Syt1P46096 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Syt1P46096 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Syt1P46096 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Syt1P46096 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Syt1P46096 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Syt1P46096 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Syt1P46096 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Syt1P46096 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Syt1P46096 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Syt1P46096 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Syt1P46096 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Syt1P46096 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Syt1P46096 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Syt1P46096 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Syt1P46096 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Syt1P46096 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Syt1P46096 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Syt1P46096 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Syt1P46096 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Syt1P46096 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Syt1P46096 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Syt1P46096 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Syt1P46096 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Syt1P46096 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Syt1P46096 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Syt1P46096 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Syt1P46096 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Syt1P46096 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Syt1P46096 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Syt1P46096 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Syt1P46096 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Syt1P46096 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Syt1P46096 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Syt1P46096 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Syt1P46096 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Syt1P46096 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Syt1P46096 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Syt1P46096 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Syt1P46096 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Syt1P46096 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Syt1P46096 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Syt1P46096 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Syt1P46096 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Syt1P46096 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Syt1P46096 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Syt1P46096 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Syt1P46096 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Syt1P46096 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Syt1P46096 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Syt1P46096 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Syt1P46096 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Syt1P46096 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Syt1P46096 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Syt1P46096 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Syt1P46096 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Syt1P46096 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Syt1P46096 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Syt1P46096 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Syt1P46096 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Syt1P46096 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Syt1P46096 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Syt1P46096 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Syt1P46096 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Syt1P46096 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Syt1P46096 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Syt1P46096 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Syt1P46096 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Syt1P46096 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms