Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
Trmt44Q9D2Q2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Trmt44Q9D2Q2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Trmt44Q9D2Q2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Trmt44Q9D2Q2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Trmt44Q9D2Q2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Trmt44Q9D2Q2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Trmt44Q9D2Q2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Trmt44Q9D2Q2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Trmt44Q9D2Q2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Trmt44Q9D2Q2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trmt44Q9D2Q2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Trmt44Q9D2Q2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Trmt44Q9D2Q2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Trmt44Q9D2Q2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Trmt44Q9D2Q2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Trmt44Q9D2Q2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Trmt44Q9D2Q2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Trmt44Q9D2Q2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Trmt44Q9D2Q2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Trmt44Q9D2Q2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Trmt44Q9D2Q2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trmt44Q9D2Q2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Trmt44Q9D2Q2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Trmt44Q9D2Q2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trmt44Q9D2Q2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trmt44Q9D2Q2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trmt44Q9D2Q2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Trmt44Q9D2Q2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trmt44Q9D2Q2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Trmt44Q9D2Q2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Trmt44Q9D2Q2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Trmt44Q9D2Q2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Trmt44Q9D2Q2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Trmt44Q9D2Q2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Trmt44Q9D2Q2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Trmt44Q9D2Q2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Trmt44Q9D2Q2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trmt44Q9D2Q2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Trmt44Q9D2Q2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trmt44Q9D2Q2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Trmt44Q9D2Q2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trmt44Q9D2Q2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Trmt44Q9D2Q2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trmt44Q9D2Q2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trmt44Q9D2Q2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Trmt44Q9D2Q2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trmt44Q9D2Q2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Trmt44Q9D2Q2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trmt44Q9D2Q2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trmt44Q9D2Q2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trmt44Q9D2Q2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Trmt44Q9D2Q2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trmt44Q9D2Q2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trmt44Q9D2Q2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trmt44Q9D2Q2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trmt44Q9D2Q2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Trmt44Q9D2Q2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Trmt44Q9D2Q2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Trmt44Q9D2Q2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Trmt44Q9D2Q2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Trmt44Q9D2Q2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Trmt44Q9D2Q2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Trmt44Q9D2Q2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trmt44Q9D2Q2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trmt44Q9D2Q2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Trmt44Q9D2Q2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Trmt44Q9D2Q2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trmt44Q9D2Q2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Trmt44Q9D2Q2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trmt44Q9D2Q2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trmt44Q9D2Q2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trmt44Q9D2Q2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trmt44Q9D2Q2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trmt44Q9D2Q2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trmt44Q9D2Q2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trmt44Q9D2Q2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trmt44Q9D2Q2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trmt44Q9D2Q2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trmt44Q9D2Q2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trmt44Q9D2Q2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Trmt44Q9D2Q2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Trmt44Q9D2Q2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Trmt44Q9D2Q2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trmt44Q9D2Q2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trmt44Q9D2Q2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Trmt44Q9D2Q2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Trmt44Q9D2Q2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trmt44Q9D2Q2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trmt44Q9D2Q2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trmt44Q9D2Q2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trmt44Q9D2Q2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trmt44Q9D2Q2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Trmt44Q9D2Q2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trmt44Q9D2Q2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms