Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Tubb6Q922F4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Tubb6Q922F4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Tubb6Q922F4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Tubb6Q922F4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Tubb6Q922F4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Tubb6Q922F4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Tubb6Q922F4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Tubb6Q922F4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Tubb6Q922F4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Tubb6Q922F4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tubb6Q922F4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tubb6Q922F4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Tubb6Q922F4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Tubb6Q922F4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tubb6Q922F4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Tubb6Q922F4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Tubb6Q922F4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Tubb6Q922F4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Tubb6Q922F4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Tubb6Q922F4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tubb6Q922F4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Tubb6Q922F4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Tubb6Q922F4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Tubb6Q922F4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Tubb6Q922F4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Tubb6Q922F4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Tubb6Q922F4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Tubb6Q922F4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Tubb6Q922F4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Tubb6Q922F4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tubb6Q922F4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tubb6Q922F4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Tubb6Q922F4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Tubb6Q922F4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Tubb6Q922F4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tubb6Q922F4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tubb6Q922F4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tubb6Q922F4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tubb6Q922F4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tubb6Q922F4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Tubb6Q922F4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Tubb6Q922F4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Tubb6Q922F4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tubb6Q922F4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Tubb6Q922F4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tubb6Q922F4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tubb6Q922F4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tubb6Q922F4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tubb6Q922F4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tubb6Q922F4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tubb6Q922F4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tubb6Q922F4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Tubb6Q922F4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tubb6Q922F4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Tubb6Q922F4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Tubb6Q922F4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tubb6Q922F4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubb6Q922F4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tubb6Q922F4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tubb6Q922F4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Tubb6Q922F4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Tubb6Q922F4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tubb6Q922F4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tubb6Q922F4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tubb6Q922F4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tubb6Q922F4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tubb6Q922F4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tubb6Q922F4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Tubb6Q922F4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tubb6Q922F4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tubb6Q922F4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tubb6Q922F4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tubb6Q922F4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tubb6Q922F4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Tubb6Q922F4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tubb6Q922F4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tubb6Q922F4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tubb6Q922F4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tubb6Q922F4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tubb6Q922F4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tubb6Q922F4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tubb6Q922F4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tubb6Q922F4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tubb6Q922F4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Tubb6Q922F4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tubb6Q922F4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tubb6Q922F4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tubb6Q922F4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tubb6Q922F4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tubb6Q922F4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tubb6Q922F4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tubb6Q922F4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tubb6Q922F4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tubb6Q922F4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tubb6Q922F4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tubb6Q922F4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tubb6Q922F4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tubb6Q922F4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tubb6Q922F4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms