RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C BMH2P34730 273 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RPN10P38886 268 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C DUN1P39009 513 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C FHL1P39521 936 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data4.15□□□□□ -1.75not detected
SUP53tL(CAA)C PEX13P80667 386 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TOF2Q02208 771 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YPL014WQ02606 381 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YLH47Q06493 454 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YOL073CQ08232 322 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C GPR1Q12361 961 aa4.15□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TUF1P02992 437 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CHS1P08004 1131 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SEC63P14906 663 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TGL4P36165 910 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C IML2P47031 731 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YGR153WP48238 217 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C HXT17P53631 564 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TOF1P53840 1238 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SWS2P53937 143 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YFT2Q06676 274 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ALR1Q08269 859 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SMC6Q12749 1114 aa4.14□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C STT4P37297 1900 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SSB1P11484 613 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PFK1P16861 987 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C DAL82P21705 255 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ERG6P25087 383 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RPC53P25441 422 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PMI40P29952 429 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C DSS4P32601 143 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C FBP26P32604 452 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ATG12P38316 186 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CHS7P38843 316 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SSB2P40150 613 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ROG3P43602 733 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CIS3P47001 227 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C COQ5P49017 307 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CUE3P53137 624 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C GUP1P53154 560 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NAF1P53919 492 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RSB1Q08417 382 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TAF10Q12030 206 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C LCB4Q12246 624 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NAG1Q8TGN9 163 aa4.13□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PTP1P25044 335 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C FRE1P32791 686 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ASG1P40467 964 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NUP84P52891 726 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SHE10P53075 577 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data4.12□□□□□ -1.75not detected
SUP53tL(CAA)C CBK1P53894 756 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C MUB1Q03162 620 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PIR3Q03180 325 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C TRM82Q03774 444 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YPR027CQ12079 277 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C DYN1P36022 4092 aa4.12□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C COX3P00420 269 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C FRS2P15625 503 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CIN8P27895 1000 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YJU3P28321 313 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C BRF1P29056 596 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RAM2P29703 316 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C LYP1P32487 611 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PET10P36139 283 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SAK1P38990 1142 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SER33P40510 469 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NPA3P47122 385 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PEX14P53112 341 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C FLC3P53121 802 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SDA1P53313 767 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NDD1Q08887 554 aa4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C IPP1P00817 287 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ARF2P19146 181 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C IME1P21190 360 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CAP1P28495 268 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C VPS35P34110 944 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C BRN1P38170 754 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SHE3P38272 425 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C AIM9P40053 627 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C NUP82P40368 713 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CDC1P40986 491 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C GUF1P46943 645 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C HSH155P49955 971 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PYK2P52489 506 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YGL140CP53120 1219 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C SNO2P53823 222 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RPN4Q03465 531 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C YML096WQ04489 525 aa4.1□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C HXT13P39924 564 aa4.09□□□□□ -1.75
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