RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	MEP3	P53390	489 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	GIS4	Q04233	774 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ESS1	P22696	170 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CDC15	P27636	974 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	PTP2	P29461	750 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CBF2	P32504	956 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	HSP78	P33416	811 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RTS1	P38903	757 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	UBP9	P39967	754 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	STU2	P46675	888 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MDR1	P53258	950 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YNR063W	P53749	607 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	GIM3	P53900	129 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	UBP2	Q01476	1272 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SPO19	Q03029	223 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	BRE4	Q07660	1125 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MSR1	P38714	643 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RTT107	P38850	1070 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	NUP85	P46673	744 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SMC3	P47037	1230 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	FLC1	Q08967	793 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ARG81	P05085	880 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	PMA2	P19657	947 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MIH1	P23748	554 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RDH54	P38086	958 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YHL041W	P38730	149 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MTW1	P39731	289 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ISM1	P48526	1002 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	LSC2	P53312	427 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YGR273C	P53329	174 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ESC2	Q06340	456 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CRN1	Q06440	651 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ATG20	Q07528	640 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	LOT6	Q07923	191 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MMP1	Q12372	583 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SCJ1	P25303	377 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	OCA4	P25366	362 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RPC53	P25441	422 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YJU3	P28321	313 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CLB5	P30283	435 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SRB4	P32569	687 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	NUF2	P33895	451 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	NEO1	P40527	1151 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	JJJ2	P46997	583 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RPN14	P53196	417 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YAP1802	P53309	568 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	UFO1	Q04511	668 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YLR287C	Q05881	355 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MMR1	Q06324	491 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	OPY2	Q06810	360 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RAD61	Q99359	647 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	GSC2	P40989	1895 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	FLO11	P08640	1367 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YEL043W	P32618	956 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YEL1	P34225	687 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	PXL1	P36166	706 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	APD1	P38281	316 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	FTH1	P38310	465 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	UBX7	P38349	436 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	SPO74	P45819	413 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	YGR067C	P53243	804 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	VPS30	Q02948	557 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MUB1	Q03162	620 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	ECM11	Q04110	302 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	TDA9	Q04545	1251 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	CIR2	Q08822	631 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	MYO1	P08964	1928 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GPT2	YKR067W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms