RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YGL242C	P53066	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MLC1	P53141	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	VPS62	P53285	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	UME1	Q03010	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	FCP1	Q03254	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	UGO1	Q03327	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	TRE2	Q08693	809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RTP1	Q12751	981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PDR18	P53756	1333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	BI4	P03879	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ACE2	P21192	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	EMC1	P25574	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RIM4	P38741	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PHO23	P50947	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YGR053C	P53234	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SLI1	P53304	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SUN4	P53616	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MSC2	Q03455	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	EAF1	Q06337	982 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	CTI6	Q08923	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RRI2	Q12348	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	FOB1	O13329	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PIF1	P07271	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YKL069W	P36088	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YBR184W	P38299	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	IES5	P40060	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	IRC3	Q06683	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	STE11	P23561	717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MRP8	P35719	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PFF1	P38244	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MSE1	P48525	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	HFM1	P51979	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SPC105	P53148	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	GIS1	Q03833	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	THI73	Q07904	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PSR2	Q07949	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	HMI1	Q12039	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	GNT1	Q12096	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	NTO1	Q12311	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SLA2	P33338	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PEX6	P33760	1030 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	IRR1	P40541	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ESC2	Q06340	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ACM1	Q08981	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	POM152	P39685	1337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MUM2	P38236	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PNT1	P38969	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PIP2	P52960	996 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	UBP16	Q02863	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	UBX2	Q04228	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	THI3	Q07471	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	XYL2	Q07993	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MPD2	Q99316	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	GSY1	P23337	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MGM1	P32266	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	DUT1	P33317	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PLB1	P39105	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	TMA108	P40462	946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MND2	P40577	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MRPS35	P53292	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YNL193W	P53870	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ERO1	Q03103	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	HFD1	Q04458	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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