RNA–Protein interactions for RNA: YGL137W

SEC27, Transcript of Essential beta'-coat protein of the COPI coatomer, yeast

Gene SEC27, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC27	YGL137W	NCS6	P53088	359 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	NPY1	P53164	384 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	RSM24	Q03976	319 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	TOS1	P38288	455 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	BIT2	P38346	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	BEM4	P39011	633 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PCL10	P53124	433 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MRPS35	P53292	345 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	HMI1	Q12039	706 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MSS4	P38994	779 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	CHA4	P43634	648 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MET12	P46151	657 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MET14	Q02196	202 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	TPO1	Q07824	586 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SWI6	P09959	803 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	TDA3	P38758	523 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	DID4	P36108	232 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	GID8	P40208	455 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SHR5	P41912	237 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SSY5	P47002	699 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	ROT1	Q03691	256 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	ENA1	P13587	1091 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	LRG1	P35688	1017 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PIP2	P52960	996 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PDR11	P40550	1411 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	IME1	P21190	360 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	YPT7	P32939	208 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SAP190	P36123	1033 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	VPS62	P53285	467 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	YPS7	Q06325	596 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	LAS17	Q12446	633 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
SEC27	YGL137W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PFA3	P42836	336 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	INP52	P50942	1183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	RMP1	Q12530	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	IML1	P47170	1584 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MSS18	P08593	268 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
SEC27	YGL137W	YHR078W	P38799	552 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SKY1	Q03656	742 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	IES1	P43579	692 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	ASI2	P53895	289 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MED7	Q08278	222 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	NUP192	P47054	1683 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SEC65	P29478	273 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	LAM1	P38851	1228 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	SAK1	P38990	1142 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	MEF2	P39677	819 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	ERG5	P54781	538 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	PHM6	Q05637	104 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SEC27	YGL137W	USO1	P25386	1790 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	POA1	P38218	177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YFL052W	P43551	465 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YHM2	Q04013	314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	HIS5	P07172	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	KCC4	P25389	1037 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	EMC1	P25574	760 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	ATG19	P35193	415 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YHR202W	P38887	602 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	VHR1	P40522	640 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	DAS1	P47005	663 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	CIA1	Q05583	330 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	SGD1	Q06132	899 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	YKU70	P32807	602 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	NIC96	P34077	839 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SEC27	YGL137W	EAF5	P39995	279 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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