RNA–Protein interactions for RNA: YPL283C

YRF1-7, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-7, Length 5,580 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7YPL283C ABP140Q08641 628 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C DAS2Q12084 232 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C KRS1P15180 591 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C HAL5P38970 855 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TOM22P49334 152 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SRN2Q99176 213 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C NMT1P14743 455 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C IRE1P32361 1115 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C KTR4P38131 464 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RPT2P40327 437 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YGR111WP53265 400 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C LSC2P53312 427 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C NAT1P12945 854 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SSO1P32867 290 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C KHA1P40309 873 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TY3A-GQ12173 290 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TY3A-IQ99219 290 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C VPS1P21576 704 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SSO2P39926 295 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YEL025CP39991 1188 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ATG32P40458 529 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C HLJ1P48353 224 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PPN1Q04119 674 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C THI21Q08975 551 aa8.31□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SWE1P32944 819 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C UPF3P48412 387 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TRF5P48561 642 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C FPK1P53739 893 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RAD18P10862 487 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data8.3□□□□□ -1.08not detected
YRF1-7YPL283C ROG3P43602 733 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SKY1Q03656 742 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C JJJ3P47138 172 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YGL138CP53122 345 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C VTA1Q06263 330 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C COX6P00427 148 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SNA3P14359 133 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C CIN4P39110 191 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C NPR2P39923 615 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ECI1Q05871 280 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YDR056CQ12025 205 aa8.3□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C KIN1P13185 1064 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C MIP1P15801 1254 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YME1P32795 747 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C MMS4P38257 691 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C BUD14P27637 709 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C NOP9P47077 666 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RTT102P53330 157 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PRM6Q04705 352 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RVS161P25343 265 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RTG2P32608 588 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C INA17Q02888 182 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YLR407WQ06070 228 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C DNF3Q12674 1656 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ERP6P53198 216 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ALG11P53954 548 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C GYL1Q04322 720 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C VPH1P32563 840 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RSC4Q02206 625 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TPO1Q07824 586 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C FRA1Q07825 749 aa8.29□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PHO13P19881 312 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C UBP7P40453 1071 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C MIC19P43594 170 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C DIP5P53388 608 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data8.28□□□□□ -1.08not detected
YRF1-7YPL283C SEC1P30619 724 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PRO3P32263 286 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C GLC3P32775 704 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YGR125WP53273 1036 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ATG20Q07528 640 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ADH4P10127 382 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C YMR134WP40207 237 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C MCM6P53091 1017 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C RLI1Q03195 608 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C ARP6Q12509 438 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C TVP38P36164 337 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C PFD1P46988 109 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SHR3Q02774 210 aa8.28□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C MEF1P25039 761 aa8.27□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C NUF2P33895 451 aa8.27□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C CRN1Q06440 651 aa8.27□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C SUE1Q06524 206 aa8.27□□□□□ -1.08
YRF1-7YPL283C FOB1O13329 566 aa8.27□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C OTU2P38747 307 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C ETP1P38748 585 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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