RNA–Protein interactions for RNA: YMR204C

INP1, Transcript of Peripheral membrane protein of peroxisomes, yeast

Gene INP1, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP1	YMR204C	FLO10	P36170	1169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
INP1	YMR204C	ECM1	P39715	212 aa		4.78	□□□□□ -1.64
INP1	YMR204C	HXT16	P47185	567 aa		4.78	□□□□□ -1.64
INP1	YMR204C	ARO10	Q06408	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
INP1	YMR204C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.78	□□□□□ -1.64
INP1	YMR204C	CAN1	P04817	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	ADY2	P25613	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	PER1	P25625	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	RTA1	P53047	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	NDC80	P40460	691 aa		4.76	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	ALY2	P47029	1046 aa		4.76	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	HUL5	P53119	910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	TAF3	Q12297	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.76	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	SIR3	P06701	978 aa		4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	MDM10	P18409	493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	SPO11	P23179	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	GAL11	P19659	1081 aa		4.74	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	MTL1	P53214	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	HOF1	Q05080	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	SFB3	P38810	929 aa		4.73	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	FMO1	P38866	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.73	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	CTR1	P49573	406 aa		4.73	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.73	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	GLG1	P36143	616 aa		4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	YHR112C	P38716	378 aa		4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	ARG2	P40360	574 aa		4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	ORC4	P54791	529 aa		4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	THI7	Q05998	598 aa		4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	AFT2	Q08957	416 aa		4.72	□□□□□ -1.65
INP1	YMR204C	RPN13	O13563	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	EMP70	P32802	667 aa		4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	APT2	P36973	181 aa		4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	NUP60	P39705	539 aa		4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	BDH2	P39713	417 aa		4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	YEL020C	P39994	560 aa		4.71	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	LYS9	P38999	446 aa		4.7	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	YFL052W	P43551	465 aa		4.7	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.7	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
INP1	YMR204C	FHN1	P53279	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	ATG4	P53867	494 aa		4.69	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	MCM21	Q06675	368 aa		4.69	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	PHO11	P35842	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	UBS1	P38290	277 aa		4.68	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	PHO12	P38693	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	BNA2	P47125	453 aa		4.68	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.68	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	MTC2	P34246	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	GDH3	P39708	457 aa		4.67	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	MCD4	P36051	919 aa		4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	NPY1	P53164	384 aa		4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	MLH3	Q12083	715 aa		4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.66	□□□□□ -1.66
INP1	YMR204C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	NSE3	Q05541	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
INP1	YMR204C	ORC2	P32833	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	REC102	Q02721	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	USV1	Q12132	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	ICT1	Q12385	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	YAP7	Q08182	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	VPS34	P22543	875 aa		4.62	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	PAC2	P39937	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	GET2	P40056	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
INP1	YMR204C	FUB1	P25659	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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