RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FPR4	YLR449W	YMR187C	Q03236	431 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	MSC2	Q03455	724 aa		13.83	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	RRT2	P38332	387 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ECM3	Q99252	613 aa		13.82	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SAK1	P38990	1142 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	AIM21	P40563	679 aa		13.81	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	WHI2	P12611	486 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	BRO1	P48582	844 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	TDA9	Q04545	1251 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	AIM41	Q12032	185 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SRF1	Q12516	437 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ATG11	Q12527	1178 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	YER152C	P10356	443 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SFL1	P20134	766 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	MSH1	P25846	959 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	DBF4	P32325	704 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	MSS51	P32335	436 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ASG1	P40467	964 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	ISM1	P48526	1002 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	RIM8	P53179	542 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SHS1	Q07657	551 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	BI2	P03873	423 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	BI4	P03879	638 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	COX4	P04037	155 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	TRM2	P33753	639 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	YMC2	P38087	329 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	RNT1	Q02555	471 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FPR4	YLR449W	PDR1	P12383	1068 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	CBF2	P32504	956 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RRN6	P32786	894 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PTC4	P38089	393 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	END3	P39013	349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YJR039W	P47107	1121 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	ZPS1	Q12512	249 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RRT12	P25381	491 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YHR054C	P38780	354 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YAP1801	P38856	637 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	SKP2	P42843	763 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	ULI1	P43604	169 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	TOM1	Q03280	3268 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	GLN3	P18494	730 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	BCS1	P32839	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PRY3	P47033	881 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	HOP2	P53187	214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	STE23	Q06010	1027 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	GAL10	P04397	699 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PMS1	P14242	873 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	BUD2	P33314	1104 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PXA1	P41909	870 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YNL320W	P42840	284 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	ZAP1	P47043	880 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YGR130C	P53278	816 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	GYL1	Q04322	720 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	YDR278C	Q05612	105 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PEP5	P12868	1029 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	SAD1	P43589	448 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	NMD5	P46970	1048 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RTP1	Q12751	981 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	PRR1	P28708	518 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	MRP4	P32902	394 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FPR4	YLR449W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22

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