RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C VAC17P25591 423 aa6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RPT1P33299 467 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C GRS1P38088 690 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RTT107P38850 1070 aa6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C FIR1P40020 876 aa6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SSB2P40150 613 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C HSH155P49955 971 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SLX4Q12098 748 aa6.21□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ADE4P04046 510 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C TEC1P18412 486 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CDC11P32458 415 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YKL023WP36103 277 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SAP190P36123 1033 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C DRE2P36152 348 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C POA1P38218 177 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C MMS4P38257 691 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SPT8P38915 602 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C VFA1P40080 203 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C TAD1P53065 400 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.2□□□□□ -1.42not detected
RRP4YHR069C YLR297WQ05899 129 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C PCD1Q12524 340 aa6.2□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CDC42P19073 191 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C IME1P21190 360 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CAD1P24813 409 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C FUB1P25659 250 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SKG6P32900 734 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data6.19□□□□□ -1.42not detected
RRP4YHR069C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YFL040WP43562 540 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C DAS1P47005 663 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C GCV2P49095 1034 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YGR035CP53222 116 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YPR084WQ06821 456 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SHS1Q07657 551 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C APL4Q12028 832 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C MCM16Q12262 181 aa6.19□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C PRR1P28708 518 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C KIP2P28743 706 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ISF1P32488 338 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C MAC1P35192 417 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YHL026CP38740 315 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YER186CP40101 306 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SDS3P40505 327 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data6.18□□□□□ -1.42not detected
RRP4YHR069C FYV8P46949 817 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ZAP1P47043 880 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C FOL2P51601 243 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C UME1Q03010 460 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C PPM1Q04081 328 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C HMI1Q12039 706 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C GIS3Q12418 502 aa6.18□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SWI6P09959 803 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ASP3-2P0CX77 362 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ASP3-3P0CX78 362 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ASP3-4P0CX79 362 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ASP3-1P0CZ17 362 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SPO12P17123 173 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SLX1P38324 304 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C LAM5P43560 674 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ATG9Q12142 997 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YOR022CQ12204 715 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YLR422WQ06409 1932 aa6.17□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C HIP1P06775 603 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C NAT1P12945 854 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C KIP1P28742 1111 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SWI3P32591 825 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C XRS2P33301 854 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CCC2P38995 1004 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C FTR1P40088 404 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C IES1P43579 692 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CPR7P47103 393 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C COS5P47187 383 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C ESBP6P53918 673 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C HED1Q03937 162 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C YLR287CQ05881 355 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RGA2Q06407 1009 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C PLP2Q12017 286 aa6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C CYC8P14922 966 aa6.15□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C RSA4P25382 515 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C GUT2P32191 649 aa6.15□□□□□ -1.42
RRP4YHR069C SMC1P32908 1225 aa6.15□□□□□ -1.42
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