RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	NUC1	P08466	329 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	MRPL40	P36534	297 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	PXA1	P41909	870 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	YMR018W	Q04364	514 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	YRR1	Q12172	810 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CTH1	P47976	325 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	RTA1	P53047	317 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	GTR1	Q00582	310 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
DNF2	YDR093W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	IES3	Q12345	250 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	YDL129W	Q07555	291 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SEC39	Q12745	709 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SFL1	P20134	766 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	COQ8	P27697	501 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	TVP38	P36164	337 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	GIC1	P38785	314 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	IRR1	P40541	1150 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	NCR1	Q12200	1170 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	MCM1	P11746	286 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	MAS2	P11914	482 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CBP3	P21560	335 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	KDX1	P36005	433 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	PIH1	P38768	344 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	AIM21	P40563	679 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	MCD1	Q12158	566 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	RAD18	P10862	487 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	KIN1	P13185	1064 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CBS2	P14905	389 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	NGG1	P32494	702 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	MAL33	P38157	468 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SPO19	Q03029	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ARG7	Q04728	441 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CRN1	Q06440	651 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	OPT2	Q06593	877 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	VAC14	Q06708	880 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	TRE2	Q08693	809 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CDC16	P09798	840 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	NPR3	P38742	1146 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	NPR2	P39923	615 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SPO74	P45819	413 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	UBX4	P54730	416 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	DRE2	P36152	348 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	VPS41	P38959	992 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	HXT8	P40886	569 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ARA2	Q04212	335 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CST9	Q06032	482 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	GPA1	P08539	472 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ASK1	P35734	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	GUP1	P53154	560 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	UME1	Q03010	460 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	VPS16	Q03308	798 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	IVY1	Q04934	453 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	YCS4	Q06156	1176 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	LDB19	Q12502	818 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	YBP1	P38315	674 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	DSL1	P53847	754 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	ICL2	Q12031	575 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SGE1	P33335	543 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	VPS25	P47142	202 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	GCV1	P48015	400 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	REG1	Q00816	1014 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	TRS130	Q03660	1102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DNF2	YDR093W	SLY1	P22213	666 aa		5.09	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	KIP1	P28742	1111 aa		5.09	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	UFE1	P41834	346 aa		5.09	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CIT3	P43635	486 aa		5.09	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6

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