RNA–Protein interactions for RNA: YBL003C

HTA2, Transcript of Histone H2A, yeast

Gene HTA2, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTA2	YBL003C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	GRC3	Q07845	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SNF5	P18480	905 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PHO3	P24031	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YCL002C	P25565	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YKL050C	P35736	922 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	VPS8	P39702	1274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ICP55	P40051	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CEP3	P40969	608 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YFL066C	P43538	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	TPP1	Q03796	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RSB1	Q08417	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NUR1	Q12066	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NSI1	Q12457	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PRC1	P00729	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NUC1	P08466	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	DGR2	P32330	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	MDL2	P33311	773 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SLC1	P33333	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	TGL1	P34163	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NUP120	P35729	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YKR051W	P36142	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	FAT1	P38225	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	STL1	P39932	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SGM1	P47166	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PUS2	P53167	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SFB2	P53953	876 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CIA1	Q05583	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PSF3	Q12146	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PHM7	Q12252	991 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SWI6	P09959	803 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ACE2	P21192	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PXA2	P34230	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	MRPL36	P36531	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	APM3	P38153	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	POA1	P38218	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NPP2	P39997	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PCL10	P53124	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SGD1	Q06132	899 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RSC58	Q07979	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SDH5	Q08230	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	HIF1	Q12373	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ATP12	P22135	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	STE13	P33894	931 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	GPT2	P36148	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	FLR1	P38124	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	UME6	P39001	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	YFL054C	P43549	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	ALT1	P52893	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	HDA1	P53973	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RCF1	Q03713	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	THI21	Q08975	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	DCS2	Q12123	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
HTA2	YBL003C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	RRM3	P38766	723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	BCD1	P38772	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	BEM4	P39011	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HTA2	YBL003C	SAP4	P53036	818 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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