RNA–Protein interactions for RNA: YAL003W

EFB1, Transcript of Translation elongation factor 1 beta, yeast

Gene EFB1, Length 621 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFB1	YAL003W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MED1	Q12321	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	TRP3	P00937	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	KIN82	P25341	720 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	RPC53	P25441	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PSO2	P30620	661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YSC83	P32792	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CTM1	P38818	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	BIM1	P40013	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YJR107W	P47145	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SCS3	P53012	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YNR040W	P53736	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	TOF1	P53840	1238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	ARK1	P53974	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	COQ9	Q05779	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	TMA16	Q08687	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SUT2	Q12286	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PHO8	P11491	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SNA3	P14359	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	DAL7	P21826	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SFA1	P32771	386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YET1	P35723	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MNN4	P36044	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PXL1	P36166	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	FLR1	P38124	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	EFM2	P38347	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	EAF5	P39995	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SKP2	P42843	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	TOS3	P43637	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	RTT102	P53330	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	VPS75	P53853	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MSC2	Q03455	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MRX10	Q05648	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	OSW2	Q12202	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	HIF1	Q12373	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	RIF1	P29539	1916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MRP10	O75012	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CYT1	P07143	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MAS2	P11914	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PHO13	P19881	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SPO11	P23179	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MSH3	P25336	1018 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	APL1	P27351	700 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MCM2	P29469	868 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	DPH2	P32461	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	BCS1	P32839	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YEL1	P34225	687 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	UBP5	P39944	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SHE10	P53075	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	TAM41	P53230	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	ULP1	Q02724	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	DON1	Q05610	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YAP7	Q08182	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	IES4	Q08561	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PLP2	Q12017	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	HFI1	Q12060	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	RTP1	Q12751	981 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	TSC13	Q99190	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SPC110	P32380	944 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	PAH1	P32567	862 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	ERC1	P38767	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SPT8	P38915	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	AFG3	P39925	761 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	LCB2	P40970	561 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	COS5	P47187	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	VPS62	P53285	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	VTC3	Q02725	835 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	ECM7	Q06200	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	SPO75	Q07798	868 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	MED7	Q08278	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFB1	YAL003W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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