RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccer1Q9CQL2 403 aa26.8■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pdzd9Q9D9M4 266 aa26.8■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnaaf4Q8R368 420 aa26.79■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pcdhb15Q91Y04 786 aa26.79■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Erc1Q99MI1 1120 aa26.79■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ms4a1P19437 291 aa26.79■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zfp397Q7TNK4 527 aa26.78■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cnpy2Q9QXT0 182 aa26.78■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ttll7A4Q9F0 912 aa26.78■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cct2P80314 535 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dhx38Q80X98 1228 aa26.78■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Prl7a2O54831 253 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tmem109Q3UBX0 243 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fbxl16A2RT62 479 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 TrhQ62361 256 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Usp44Q8C2S0 711 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 InsrrQ9WTL4 1300 aa26.77■■□□□ 1.88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ppfia3P60469 1194 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zkscan4Q5SZT6 480 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gli3Q61602 1583 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hspa2P17156 633 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Iqsec3Q3TES0 1195 aa26.76■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atf3Q60765 181 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam43aQ8BUP8 424 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kcnk13Q8R1P5 405 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Prkab2Q6PAM0 271 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm21985Q6P6P5 1106 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pms1Q8K119 917 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rufy2Q8R4C2 606 aa26.75■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fsd1Q7TPM6 496 aa26.74■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa26.74■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 LratQ9JI60 231 aa26.74■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 NmiO35309 314 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mb21d2Q8C525 428 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 TkfcQ8VC30 578 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 BrapQ99MP8 591 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Morc2aQ69ZX6 1030 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Farp2Q91VS8 1065 aa26.73■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mtx1P47802 317 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr17E9Q271 1322 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Robo1O89026 1612 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nfatc2ipO09130 412 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Frat1P70339 274 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gnat3Q3V3I2 354 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Soga3Q6NZL0 945 aa26.72■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ap5z1Q3U829 807 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ripor2Q80U16 1078 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Golim4Q8BXA1 655 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 CenpqQ9CPQ5 267 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atp2b1G5E829 1220 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 ThemisQ8BGW0 636 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc39a6Q8C145 765 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dusp10Q9ESS0 483 aa26.71■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Q8BZJ8 459 aa26.7■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pus3Q9JI38 481 aa26.7■■□□□ 1.87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Simc1E9Q6E9 1354 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 NpeppsQ11011 920 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fkbp5Q64378 456 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc82Q6PG04 518 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa26.69■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 MypnQ5DTJ9 1315 aa26.68■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ints4Q8CIM8 964 aa26.68■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Phkg2Q9DB30 406 aa26.68■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cfap99A0A140LIX9 648 aa26.68■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa26.68■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ddx60E9PZQ1 1711 aa26.68■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tpm1P58771 284 aa26.67■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ddx58Q6Q899 926 aa26.67■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lmbrd2Q8C561 694 aa26.67■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trim59Q922Y2 403 aa26.67■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Col15a1O35206 1367 aa26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 LyarQ08288 388 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Brinp3Q499E0 766 aa26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 TnrQ8BYI9 1358 aa26.66■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dzip1Q8BMD2 852 aa26.65■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ift57Q8BXG3 429 aa26.65■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rgs9O54828 675 aa26.64■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc129Q14B48 1034 aa26.64■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chmp3Q9CQ10 224 aa26.64■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 PigbQ9JJQ0 542 aa26.64■■□□□ 1.86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sult6b1P0CC03 303 aa26.63■■□□□ 1.85
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ankle2Q6P1H6 964 aa26.63■■□□□ 1.85
Nisch-222ENSMUST00000172142 Stk38Q91VJ4 465 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.4 ms