Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,28■■■■■ 4,36
Rgs9O54828 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Rgs9O54828 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Rgs9O54828 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Rgs9O54828 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Rgs9O54828 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Rgs9O54828 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,56■■■■□ 3,6
Rgs9O54828 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Rgs9O54828 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Rgs9O54828 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Rgs9O54828 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Rgs9O54828 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Rgs9O54828 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Rgs9O54828 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Rgs9O54828 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Rgs9O54828 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Rgs9O54828 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Rgs9O54828 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Rgs9O54828 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Rgs9O54828 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Rgs9O54828 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Rgs9O54828 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Rgs9O54828 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Rgs9O54828 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Rgs9O54828 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Rgs9O54828 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Rgs9O54828 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Rgs9O54828 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Rgs9O54828 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Rgs9O54828 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Rgs9O54828 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Rgs9O54828 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Rgs9O54828 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Rgs9O54828 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Rgs9O54828 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Rgs9O54828 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Rgs9O54828 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Rgs9O54828 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Rgs9O54828 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Rgs9O54828 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Rgs9O54828 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Rgs9O54828 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Rgs9O54828 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Rgs9O54828 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,06
Rgs9O54828 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Rgs9O54828 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Rgs9O54828 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Rgs9O54828 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,01■■■■□ 3,04
Rgs9O54828 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Rgs9O54828 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Rgs9O54828 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Rgs9O54828 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Rgs9O54828 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Rgs9O54828 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Rgs9O54828 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Rgs9O54828 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Rgs9O54828 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Rgs9O54828 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Rgs9O54828 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Rgs9O54828 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Rgs9O54828 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Rgs9O54828 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Rgs9O54828 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Rgs9O54828 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Rgs9O54828 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Rgs9O54828 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Rgs9O54828 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Rgs9O54828 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Rgs9O54828 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Rgs9O54828 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Rgs9O54828 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Rgs9O54828 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Rgs9O54828 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Rgs9O54828 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Rgs9O54828 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Rgs9O54828 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Rgs9O54828 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Rgs9O54828 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Rgs9O54828 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Rgs9O54828 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Rgs9O54828 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Rgs9O54828 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Rgs9O54828 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Rgs9O54828 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rgs9O54828 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rgs9O54828 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rgs9O54828 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Rgs9O54828 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Rgs9O54828 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Rgs9O54828 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Rgs9O54828 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Rgs9O54828 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Rgs9O54828 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Rgs9O54828 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Rgs9O54828 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Rgs9O54828 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Rgs9O54828 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Rgs9O54828 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Rgs9O54828 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Rgs9O54828 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms