Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Rgs9O54828 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Rgs9O54828 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Rgs9O54828 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rgs9O54828 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rgs9O54828 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rgs9O54828 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Rgs9O54828 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Rgs9O54828 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rgs9O54828 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Rgs9O54828 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rgs9O54828 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rgs9O54828 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Rgs9O54828 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rgs9O54828 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rgs9O54828 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rgs9O54828 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rgs9O54828 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rgs9O54828 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rgs9O54828 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rgs9O54828 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rgs9O54828 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rgs9O54828 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rgs9O54828 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rgs9O54828 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rgs9O54828 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rgs9O54828 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Rgs9O54828 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Rgs9O54828 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rgs9O54828 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rgs9O54828 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rgs9O54828 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rgs9O54828 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rgs9O54828 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rgs9O54828 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rgs9O54828 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rgs9O54828 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rgs9O54828 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rgs9O54828 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rgs9O54828 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rgs9O54828 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Rgs9O54828 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rgs9O54828 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rgs9O54828 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rgs9O54828 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rgs9O54828 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rgs9O54828 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Rgs9O54828 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rgs9O54828 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rgs9O54828 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rgs9O54828 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rgs9O54828 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rgs9O54828 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rgs9O54828 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rgs9O54828 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rgs9O54828 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rgs9O54828 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rgs9O54828 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Rgs9O54828 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rgs9O54828 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rgs9O54828 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rgs9O54828 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rgs9O54828 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rgs9O54828 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rgs9O54828 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rgs9O54828 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rgs9O54828 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rgs9O54828 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rgs9O54828 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rgs9O54828 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rgs9O54828 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rgs9O54828 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rgs9O54828 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rgs9O54828 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rgs9O54828 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rgs9O54828 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rgs9O54828 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rgs9O54828 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rgs9O54828 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rgs9O54828 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rgs9O54828 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rgs9O54828 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rgs9O54828 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rgs9O54828 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rgs9O54828 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rgs9O54828 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rgs9O54828 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rgs9O54828 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rgs9O54828 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rgs9O54828 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rgs9O54828 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rgs9O54828 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rgs9O54828 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rgs9O54828 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rgs9O54828 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rgs9O54828 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rgs9O54828 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rgs9O54828 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rgs9O54828 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rgs9O54828 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms