Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,89■■■■■ 4,46
Ppfia3P60469 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Ppfia3P60469 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Ppfia3P60469 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Ppfia3P60469 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Ppfia3P60469 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Ppfia3P60469 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,9■■■■□ 3,66
Ppfia3P60469 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,2■■■■□ 3,55
Ppfia3P60469 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Ppfia3P60469 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,04■■■■□ 3,52
Ppfia3P60469 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Ppfia3P60469 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Ppfia3P60469 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Ppfia3P60469 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,37■■■■□ 3,41
Ppfia3P60469 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Ppfia3P60469 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Ppfia3P60469 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Ppfia3P60469 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Ppfia3P60469 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Ppfia3P60469 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ppfia3P60469 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Ppfia3P60469 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Ppfia3P60469 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Ppfia3P60469 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Ppfia3P60469 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Ppfia3P60469 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Ppfia3P60469 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ppfia3P60469 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Ppfia3P60469 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Ppfia3P60469 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Ppfia3P60469 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Ppfia3P60469 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Ppfia3P60469 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Ppfia3P60469 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Ppfia3P60469 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Ppfia3P60469 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Ppfia3P60469 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Ppfia3P60469 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Ppfia3P60469 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Ppfia3P60469 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Ppfia3P60469 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ppfia3P60469 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ppfia3P60469 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ppfia3P60469 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ppfia3P60469 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ppfia3P60469 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Ppfia3P60469 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Ppfia3P60469 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ppfia3P60469 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Ppfia3P60469 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Ppfia3P60469 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ppfia3P60469 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ppfia3P60469 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Ppfia3P60469 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Ppfia3P60469 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
Ppfia3P60469 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Ppfia3P60469 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ppfia3P60469 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Ppfia3P60469 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Ppfia3P60469 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ppfia3P60469 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ppfia3P60469 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Ppfia3P60469 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Ppfia3P60469 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Ppfia3P60469 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Ppfia3P60469 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Ppfia3P60469 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Ppfia3P60469 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ppfia3P60469 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ppfia3P60469 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Ppfia3P60469 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Ppfia3P60469 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Ppfia3P60469 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Ppfia3P60469 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Ppfia3P60469 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,2■■■□□ 2,9
Ppfia3P60469 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Ppfia3P60469 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Ppfia3P60469 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Ppfia3P60469 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Ppfia3P60469 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Ppfia3P60469 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Ppfia3P60469 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Ppfia3P60469 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Ppfia3P60469 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Ppfia3P60469 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Ppfia3P60469 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Ppfia3P60469 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Ppfia3P60469 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Ppfia3P60469 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ppfia3P60469 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ppfia3P60469 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ppfia3P60469 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Ppfia3P60469 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ppfia3P60469 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Ppfia3P60469 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Ppfia3P60469 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Ppfia3P60469 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Ppfia3P60469 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Ppfia3P60469 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ppfia3P60469 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms