Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,18■■■■■ 4,82
Pus3Q9JI38 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Pus3Q9JI38 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Pus3Q9JI38 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Pus3Q9JI38 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Pus3Q9JI38 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,73■■■■□ 3,95
Pus3Q9JI38 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Pus3Q9JI38 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
Pus3Q9JI38 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39■■■■□ 3,83
Pus3Q9JI38 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Pus3Q9JI38 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Pus3Q9JI38 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Pus3Q9JI38 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Pus3Q9JI38 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,67■■■■□ 3,62
Pus3Q9JI38 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Pus3Q9JI38 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Pus3Q9JI38 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Pus3Q9JI38 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Pus3Q9JI38 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Pus3Q9JI38 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Pus3Q9JI38 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Pus3Q9JI38 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Pus3Q9JI38 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Pus3Q9JI38 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Pus3Q9JI38 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Pus3Q9JI38 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,69■■■■□ 3,46
Pus3Q9JI38 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Pus3Q9JI38 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Pus3Q9JI38 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,5■■■■□ 3,43
Pus3Q9JI38 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Pus3Q9JI38 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Pus3Q9JI38 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Pus3Q9JI38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Pus3Q9JI38 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Pus3Q9JI38 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Pus3Q9JI38 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Pus3Q9JI38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Pus3Q9JI38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Pus3Q9JI38 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Pus3Q9JI38 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Pus3Q9JI38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Pus3Q9JI38 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Pus3Q9JI38 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Pus3Q9JI38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Pus3Q9JI38 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Pus3Q9JI38 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Pus3Q9JI38 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Pus3Q9JI38 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Pus3Q9JI38 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Pus3Q9JI38 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Pus3Q9JI38 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Pus3Q9JI38 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Pus3Q9JI38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Pus3Q9JI38 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,91■■■■□ 3,18
Pus3Q9JI38 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Pus3Q9JI38 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Pus3Q9JI38 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,78■■■■□ 3,16
Pus3Q9JI38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Pus3Q9JI38 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Pus3Q9JI38 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,13
Pus3Q9JI38 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Pus3Q9JI38 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Pus3Q9JI38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Pus3Q9JI38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Pus3Q9JI38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Pus3Q9JI38 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Pus3Q9JI38 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Pus3Q9JI38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Pus3Q9JI38 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Pus3Q9JI38 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Pus3Q9JI38 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Pus3Q9JI38 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Pus3Q9JI38 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Pus3Q9JI38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Pus3Q9JI38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Pus3Q9JI38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Pus3Q9JI38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Pus3Q9JI38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Pus3Q9JI38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Pus3Q9JI38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Pus3Q9JI38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Pus3Q9JI38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Pus3Q9JI38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Pus3Q9JI38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,81■■■■□ 3
Pus3Q9JI38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Pus3Q9JI38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,8■■■■□ 3
Pus3Q9JI38 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Pus3Q9JI38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Pus3Q9JI38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Pus3Q9JI38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Pus3Q9JI38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Pus3Q9JI38 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Pus3Q9JI38 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Pus3Q9JI38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Pus3Q9JI38 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Pus3Q9JI38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Pus3Q9JI38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,3 ms