Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
Pus3Q9JI38 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Pus3Q9JI38 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Pus3Q9JI38 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Pus3Q9JI38 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Pus3Q9JI38 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Pus3Q9JI38 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Pus3Q9JI38 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Pus3Q9JI38 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Pus3Q9JI38 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Pus3Q9JI38 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pus3Q9JI38 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pus3Q9JI38 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Pus3Q9JI38 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Pus3Q9JI38 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Pus3Q9JI38 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Pus3Q9JI38 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Pus3Q9JI38 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pus3Q9JI38 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Pus3Q9JI38 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pus3Q9JI38 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pus3Q9JI38 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Pus3Q9JI38 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pus3Q9JI38 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pus3Q9JI38 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pus3Q9JI38 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Pus3Q9JI38 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pus3Q9JI38 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pus3Q9JI38 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Pus3Q9JI38 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pus3Q9JI38 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pus3Q9JI38 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pus3Q9JI38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pus3Q9JI38 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pus3Q9JI38 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pus3Q9JI38 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pus3Q9JI38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pus3Q9JI38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pus3Q9JI38 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pus3Q9JI38 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pus3Q9JI38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Pus3Q9JI38 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pus3Q9JI38 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pus3Q9JI38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pus3Q9JI38 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pus3Q9JI38 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pus3Q9JI38 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pus3Q9JI38 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pus3Q9JI38 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pus3Q9JI38 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pus3Q9JI38 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pus3Q9JI38 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pus3Q9JI38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pus3Q9JI38 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Pus3Q9JI38 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pus3Q9JI38 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pus3Q9JI38 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Pus3Q9JI38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pus3Q9JI38 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pus3Q9JI38 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Pus3Q9JI38 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pus3Q9JI38 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pus3Q9JI38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pus3Q9JI38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pus3Q9JI38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pus3Q9JI38 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pus3Q9JI38 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pus3Q9JI38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pus3Q9JI38 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pus3Q9JI38 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pus3Q9JI38 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Pus3Q9JI38 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Pus3Q9JI38 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pus3Q9JI38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pus3Q9JI38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pus3Q9JI38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pus3Q9JI38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pus3Q9JI38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pus3Q9JI38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pus3Q9JI38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Pus3Q9JI38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pus3Q9JI38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pus3Q9JI38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pus3Q9JI38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pus3Q9JI38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pus3Q9JI38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Pus3Q9JI38 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pus3Q9JI38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pus3Q9JI38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pus3Q9JI38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pus3Q9JI38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pus3Q9JI38 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pus3Q9JI38 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pus3Q9JI38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pus3Q9JI38 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pus3Q9JI38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pus3Q9JI38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms