RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C COY1P34237 679 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C MNR2P35724 969 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C UBP5P39944 805 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C SIP5P40210 489 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C FYV8P46949 817 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C POL31P46957 487 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C ASN1P49089 572 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C SLG1P54867 378 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C SHS1Q07657 551 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C CTF3Q12748 733 aa7.65□□□□□ -1.18
SPE3YPR069C HIS4P00815 799 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PCM1P38628 557 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C VTC2P43585 828 aa7.64□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SSB1P11484 613 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PHO8P11491 566 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PEX34P25584 144 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C MAL33P38157 468 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C YHR054CP38780 354 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SSB2P40150 613 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C TAF1P46677 1066 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C NSE5Q03718 556 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C NSE1Q07913 336 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C YPL277CQ08989 487 aa7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SPO11P23179 398 aa7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C VPS3P23643 1011 aa7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C HCM1P25364 564 aa7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PPS1P38148 807 aa7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C NPP2P39997 493 aa7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SCY1P53009 804 aa7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data7.62□□□□□ -1.19not detected
SPE3YPR069C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C CAN1P04817 590 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C TPK1P06244 397 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C ASP3-2P0CX77 362 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C ASP3-3P0CX78 362 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C ASP3-4P0CX79 362 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C ASP3-1P0CZ17 362 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C TAF13P11747 167 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C RGP1P16664 663 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PDE1P22434 369 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SGF29P25554 259 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SLA2P33338 968 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C YEL1P34225 687 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C RGD1P38339 666 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C ATH1P48016 1211 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C COG8Q04632 607 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C FMP25Q08023 583 aa7.61□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PRX1P34227 261 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C YFL034WP43564 1073 aa7.6□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PSP1P50896 841 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SFB2P53953 876 aa7.6□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C CDD1Q06549 142 aa7.6□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C BMH1P29311 267 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C HIR1P32479 840 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C ISF1P32488 338 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SEG2P34250 1132 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C PTC4P38089 393 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C SFB3P38810 929 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C DAS1P47005 663 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C VPS25P47142 202 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C VPS20Q04272 221 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C MFB1Q04922 465 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C TCO89Q08921 799 aa7.59□□□□□ -1.19
SPE3YPR069C TRP2P00899 507 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C DAL7P21826 554 aa7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RDS1P25611 832 aa7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MET4P32389 672 aa7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C HSH155P49955 971 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TUB4P53378 473 aa7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C YHM2Q04013 314 aa7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C DON1Q05610 365 aa7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C PDH1Q12428 516 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C NAT1P12945 854 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C MUD1P32605 298 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C KDX1P36005 433 aa7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C POL12P38121 705 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C DUG2P38149 878 aa7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TGL3P40308 642 aa7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C LCB2P40970 561 aa7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C CCM1P48237 864 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C STE11P23561 717 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TRK2P28584 889 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C TSA1P34760 196 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C BIM1P40013 344 aa7.56□□□□□ -1.2
SPE3YPR069C FTR1P40088 404 aa7.56□□□□□ -1.2
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