RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	SDH1	Q00711	640 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	DCS2	Q12123	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	ATP12	P22135	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CCZ1	P38273	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	JJJ3	P47138	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YHL012W	P38709	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CEP3	P40969	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CRR1	Q05790	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	GAS5	Q08193	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	OSW2	Q12202	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SHR5	P41912	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	ENT2	Q05785	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	THI21	Q08975	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SVS1	Q12254	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YVC1	Q12324	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RRI2	Q12348	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	TRK2	P28584	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SEC65	P29478	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	STE13	P33894	931 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YKR018C	P36114	725 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	AIM21	P40563	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
RTS1	YOR014W	SAP190	P36123	1033 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	ERR3	P42222	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	CIA1	Q05583	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RSC58	Q07979	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SSP2	Q08646	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RPD3	P32561	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	YFL052W	P43551	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	ARP4	P80428	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
RTS1	YOR014W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	PRC1	P00729	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	MDL2	P33311	773 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RTS1	YOR014W	SWI6	P09959	803 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HOP1	P20050	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SFA1	P32771	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	FLR1	P38124	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MAL31	P38156	614 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	TAF1	P46677	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	ZIP2	P53061	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PCL10	P53124	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HPF1	Q05164	967 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	RSB1	Q08417	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PHO81	P17442	1178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	UBA2	P52488	636 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	BUD9	P53226	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MDG1	P53885	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	OMS1	Q06668	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MSM1	P22438	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	CDC26	P14724	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MCM10	P32354	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	BEM3	P32873	1128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	ASK10	P48361	1146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	VPS30	Q02948	557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HLR1	Q04429	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	HIM1	Q06674	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	NSI1	Q12457	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTS1	YOR014W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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