RNA–Protein interactions for RNA: YML054C-A

YML054C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YML054C-A, Length 159 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML054C-AYML054C-A YBR139WP38109 508 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A ARC40P38328 384 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A YHR078WP38799 552 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A FAA2P39518 744 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A YIL108WP40483 696 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A AAT1Q01802 451 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A NRG1Q03125 231 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A PKH1Q03407 766 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A YKL033W-AQ86ZR7 236 aa0.67□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A YLR415CO13578 112 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A YMC1P32331 307 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A CDC12P32468 407 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A HOT13P36078 116 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A MNT3P40549 630 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A ORM2Q06144 216 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A YPR196WQ06595 470 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A SRL1Q08673 210 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A RKM4Q12504 494 aa0.66□□□□□ -2.3
YML054C-AYML054C-A KCC4P25389 1037 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A FUB1P25659 250 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A CDC48P25694 835 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MET4P32389 672 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RPD3P32561 433 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A BEM3P32873 1128 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A GMH1P36125 273 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YGR122WP53272 402 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A FHN1P53279 174 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A IRC3Q06683 689 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A BUD7Q08754 746 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TGL5Q12043 749 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YPL066WQ12194 479 aa0.65□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RAD2P07276 1031 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A CLN2P20438 545 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A LYP1P32487 611 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TYE7P33122 291 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YMC2P38087 329 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A CCT3P39077 534 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YIL169CP40442 995 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SKP2P42843 763 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A NMD5P46970 1048 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A HXT16P47185 567 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A HDA1P53973 706 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RTT10Q08924 1013 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TMA46Q12000 345 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ULA1Q12059 462 aa0.64□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A STE12P13574 688 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data0.63□□□□□ -2.31not detected
YML054C-AYML054C-A EXO84P38261 753 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SFB3P38810 929 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PZF1P39933 429 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A JHD1P40034 492 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YGL260WP53056 76 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ERG13P54839 491 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YKR011CQ02209 353 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SUB2Q07478 446 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A FRE7Q12333 620 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YBL113CQ7M4S9 792 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa0.63□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YPR089WO13585 888 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A INO1P11986 533 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A CYC8P14922 966 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TUP1P16649 713 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TSR4P25040 408 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MGM1P32266 881 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YKL107WP34251 309 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YBR259WP38338 688 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RTT107P38850 1070 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SNF7P39929 240 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MIT1P40002 666 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A UBP7P40453 1071 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RTT103Q05543 409 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A BSC6Q08280 497 aa0.62□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PHO5P00635 467 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RFA1P22336 621 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A RPT1P33299 467 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PHO11P35842 467 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PHO12P38693 467 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A AZF1P41696 914 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SNO3P43544 222 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A DUS1P53759 423 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TEX1P53851 422 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A APJ1P53940 528 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MRPL1Q04599 285 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A ARG7Q04728 441 aa0.61□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A TRP2P00899 507 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A THR1P17423 357 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A NPP1P25353 742 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YEL1P34225 687 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A MOT2P34909 587 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PCA1P38360 1216 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A SIC1P38634 284 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A PPX1P38698 397 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YHL050CP38721 697 aa0.6□□□□□ -2.31
YML054C-AYML054C-A YHR219WP38900 624 aa0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.3 ms