RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	SHE9	Q04172	456 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TRS120	Q04183	1289 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ATG29	Q12092	213 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ADE8	P04161	214 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	CTR86	P25355	563 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PRD1	P25375	712 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	IRE1	P32361	1115 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	COY1	P34237	679 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PAN5	P38787	379 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	XDJ1	P39102	459 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	AIM20	P40451	204 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	XKS1	P42826	600 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YNR061C	P53747	219 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	KAR5	Q04746	504 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	CRN1	Q06440	651 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PSK1	P31374	1356 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PRP28	P23394	588 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	UIP5	P36137	443 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ROM1	P53046	1155 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	BCD1	P38772	366 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TOS3	P43637	560 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YJR079W	P47126	109 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ATG34	Q12292	412 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	RAD61	Q99359	647 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YBL028C	P38202	106 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ORC6	P38826	435 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MRX1	P40050	688 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NAS2	P40555	220 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YJR008W	P47085	338 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	UBX4	P54730	416 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	KAP122	P32767	1081 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ARA1	P38115	344 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SWP82	P43554	623 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YGR125W	P53273	1036 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	HEH2	Q03281	663 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	UGO1	Q03327	502 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	FAR10	Q06001	478 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	BBP1	Q12365	385 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TYR1	P20049	452 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	KAR4	P25583	335 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MSR1	P38714	643 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YHL008C	P38750	627 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NDE1	P40215	560 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SRL4	Q03085	281 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ATG26	Q06321	1198 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YOR352W	Q08816	343 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	CSM1	P25651	190 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	LDH1	P38139	375 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	NPR3	P38742	1146 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	RRN7	P40992	514 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SML1	Q04964	104 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SCM3	Q12334	223 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YPR089W	O13585	888 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	APE1	P14904	514 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	FAR1	P21268	830 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YBR063C	P38083	404 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YDL073W	Q07454	984 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	HMS1	Q12398	434 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TGL4	P36165	910 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	TDP1	P38319	544 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YHI9	P38765	294 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	PPE1	P38796	400 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	BOI2	P39969	1040 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	DON1	Q05610	365 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MSH5	Q12175	901 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	HER1	Q12276	1246 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	MED1	Q12321	566 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	HOM3	P10869	527 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	YCR051W	P25631	222 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TOM1	YDR457W	SWC5	P38326	303 aa		2.86	□□□□□ -1.95

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