RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C RTT10Q08924 1013 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YOR223WQ12015 292 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-GR1Q12085 440 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PDR18P53756 1333 aa3.41□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YPR089WO13585 888 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C REP1P03871 373 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.86not detected
DOA4YDR069C GCR1P07261 785 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SEC23P15303 768 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SCT1P32784 759 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TAT1P38085 619 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YSW1P38280 609 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C IFA38P38286 347 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GGA2P38817 585 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ICP55P40051 511 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SAP185P40856 1058 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PRY1P47032 299 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SGM1P47166 707 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C BUD9P53226 547 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C FAR8Q05040 523 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C STE23Q06010 1027 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C OPY2Q06810 360 aa3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ADH4P10127 382 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CLB4P24871 460 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YHL012WP38709 493 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NEM1P38757 446 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ALT1P52893 592 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ARP5P53946 755 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C COG4Q06096 861 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SYO1Q07395 620 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YDL144CQ07589 356 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C LAP2Q10740 671 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C BNR1P40450 1375 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C DOP1Q03921 1698 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SWC3P31376 625 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MGM1P32266 881 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SFA1P32771 386 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HCS1P34243 683 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SEG2P34250 1132 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HSE1P38753 452 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C VAC8P39968 578 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MAM1P40065 302 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MAL13P53338 473 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C IPI3P53877 555 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C DML1Q03652 475 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C AOS1Q06624 347 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C OMS1Q06668 471 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SCM3Q12334 223 aa3.4□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C LYS2P07702 1392 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C CYB2P00175 591 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TYR1P20049 452 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C POL4P25615 582 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ADD66P36040 267 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HEL1P36113 551 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MRPL10P36520 322 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SLX1P38324 304 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ALG2P43636 503 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C DCP2P53550 970 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RTC4P53850 401 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C REX2P54964 269 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C VPS16Q03308 798 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YLH47Q06493 454 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PIN2Q12057 282 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ERP4Q12450 207 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TOM70P07213 617 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YMR085WP0CF18 432 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PMR1P13586 950 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NMT1P14743 455 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HSP30P25619 332 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C UBP13P38187 747 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C HXT7P39004 570 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YAR028WP39548 234 aa3.39□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NUP60P39705 539 aa3.39□□□□□ -1.87
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