RNA–Protein interactions for RNA: YPR017C

DSS4, Transcript of Guanine nucleotide dissociation stimulator for Sec4p, yeast

Gene DSS4, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS4	YPR017C	PTC5	Q12511	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	PIF1	P07271	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	ATE1	P16639	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	RAD27	P26793	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	MCM2	P29469	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	YJL045W	P47052	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	MLC1	P53141	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	YNL193W	P53870	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	IRC4	Q03036	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	MRL1	Q06815	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	PSF3	Q12146	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	CDC16	P09798	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	SEC8	P32855	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	LRG1	P35688	1017 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	SEA4	P38164	1038 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	ENT3	P47160	408 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	YGL242C	P53066	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	NKP2	Q06162	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	HDA2	Q06629	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	ELM1	P32801	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	CCZ1	P38273	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	SIW14	P53965	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	ORC3	P54790	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	SPR28	Q04921	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	FLO1	P32768	1537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	RAD50	P12753	1312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSS4	YPR017C	MSM1	P22438	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	KIP1	P28742	1111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YSC84	P32793	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	AIM26	P32858	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	SEG2	P34250	1132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	ALG3	P38179	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YIR042C	P40586	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	GSM1	P42950	618 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	TIM50	Q02776	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RMD1	Q03441	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	CRF1	Q04930	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RSB1	Q08417	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	FLO11	P08640	1367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	SAM35	P14693	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	AFG2	P32794	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	NIT1	P40447	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YFH7	P43591	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	TNA1	P53322	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	ROD1	Q02805	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	INM2	Q05533	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	GCR1	P07261	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
DSS4	YPR017C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	STV1	P37296	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PBY1	P38254	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	FYV10	P40492	516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	VPS4	P52917	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	MRPS35	P53292	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	SPO21	Q12411	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	CYB2	P00175	591 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	SPS1	P08458	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	MKK2	P32491	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	GPB2	P39717	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	SNF3	P10870	884 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RNQ1	P25367	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	PET112	P33893	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	GRX7	P38068	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	RGD1	P38339	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	UBP5	P39944	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSS4	YPR017C	CNN1	P43618	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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