RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A TAF7Q05021 590 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A CDC48P25694 835 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TYE7P33122 291 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YHR078WP38799 552 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RIX1P38883 763 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ELO3P40319 345 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YIR016WP40572 265 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A SAD1P43589 448 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A NET1P47035 1189 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MRPS35P53292 345 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A SFB2P53953 876 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TMN2Q04562 672 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A WHI4Q07655 649 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MKK2P32491 506 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RRT14P40470 206 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YFL054CP43549 646 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TIM54P47045 478 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TYW3P53177 273 aa1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ERG13P54839 491 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A NOG1Q02892 647 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A PMA1P05030 918 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A FUN30P31380 1131 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MTH1P35198 433 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A CTR1P49573 406 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ZDS1P50111 915 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A UBC9P50623 157 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A NOP7P53261 605 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YDR132CQ03900 495 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RPN13O13563 156 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A BI2P03873 423 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A DEF1P35732 738 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A DAK2P43550 591 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SSY5P47002 699 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A CCM1P48237 864 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MUK1Q02866 612 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VPS36Q06696 566 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YLR149CQ99296 730 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A FRT1Q99332 602 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PPR1P07272 904 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RPC82P32349 654 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SET5P38890 526 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A DSS1P39112 969 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A NDC80P40460 691 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VPS62P53285 467 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SIW14P53965 281 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YPL109CQ02981 657 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RIM13Q03792 727 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SPR28Q04921 423 aa1.02□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data1.01□□□□□ -2.25not detected
YPL060C-AYPL060C-A YIR042CP40586 236 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A REH1Q06709 432 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ENB1Q08299 606 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A HMI1Q12039 706 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SUT2Q12286 268 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MPH2P0CD99 609 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A DAL7P21826 554 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A LST4P34239 828 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A IPL1P38991 367 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MBP1P39678 833 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VAC8P39968 578 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A NOG2P53742 486 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MFM1Q02783 413 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YNL162W-AQ3E7A8 72 aa1.01□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A URE2P23202 354 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A TIF35Q04067 274 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MSC6Q08818 692 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A COBP00163 385 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A KAR4P25583 335 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A CYS3P31373 394 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VRG4P40107 337 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A THI6P41835 540 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A GCR1P07261 785 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A TOP3P13099 656 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PIG2P40187 538 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MDJ2P42834 146 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A NPY1P53164 384 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YGR122WP53272 402 aa1□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A PRP5P21372 849 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A GSY1P23337 708 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A HIR1P32479 840 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SSF1P38789 453 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A SFB3P38810 929 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A JHD1P40034 492 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YAP1802P53309 568 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A KCS1Q12494 1050 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A TRP2P00899 507 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RPD3P32561 433 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A DUR3P33413 735 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MRP8P35719 219 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A RPP1P38786 293 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A VHR1P40522 640 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A EAF1Q06337 982 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YLR040CQ07988 224 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A MDM38Q08179 573 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A YPL216WQ08964 1102 aa0.99□□□□□ -2.25
YPL060C-AYPL060C-A HEM1P09950 548 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
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