RNA–Protein interactions for RNA: YNR067C

DSE4, Transcript of Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, yeast

Gene DSE4, Length 3,354 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE4	YNR067C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CHD1	P32657	1468 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	COB	P00163	385 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RED1	P14291	827 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MNE1	P24720	663 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MSH3	P25336	1018 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RPC53	P25441	422 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	AIM46	P38885	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GUP1	P53154	560 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SKY1	Q03656	742 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PMT7	Q06644	662 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PEX15	Q08215	383 aa		3.14	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
DSE4	YNR067C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	UGA3	P26370	528 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MLS1	P30952	554 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MDJ1	P35191	511 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CCZ1	P38273	704 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	HSL7	P38274	827 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SIT1	P39980	628 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MCM1	P11746	286 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PDX1	P16451	410 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ESL2	P36168	1195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RRN7	P40992	514 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	IRC6	P43615	237 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ATG33	Q06485	197 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YPL066W	Q12194	479 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	WTM2	Q12206	467 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ISA2	Q12425	185 aa		3.13	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	DAL1	P32375	460 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CNS1	P33313	385 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	BSD2	P38356	321 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	TDA3	P38758	523 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PCL7	P40186	285 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	KEL2	P50090	882 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CBK1	P53894	756 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YPQ2	Q06328	317 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YDL073W	Q07454	984 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	IME2	P32581	645 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RTT105	P40063	208 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	UBP7	P40453	1071 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YJL055W	P47044	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	BNA2	P47125	453 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ASK10	P48361	1146 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ZDS2	P54786	942 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	ECM9	Q02202	377 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PML39	Q03760	334 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YHM2	Q04013	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	AOS1	Q06624	347 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	REX3	Q12090	404 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NUC1	P08466	329 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	HMG1	P12683	1054 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MDL1	P33310	695 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MKS1	P34072	584 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CIR1	P42940	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CAF16	P43569	289 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MAD3	P47074	515 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	TAD1	P53065	400 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MSH6	Q03834	1242 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GUP2	Q08929	609 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	NFI1	Q12216	726 aa		3.12	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
DSE4	YNR067C	FBP26	P32604	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GIP1	P38229	639 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	FTH1	P38310	465 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MDE1	P47095	244 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	HST1	P53685	503 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RAD33	Q04231	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	RNH1	Q04740	348 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	GAD1	Q04792	585 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	MFB1	Q04922	465 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE4	YNR067C	YDR338C	Q05497	695 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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