RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	RAD53	P22216	821 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	REC104	P33323	182 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	SDP1	P40479	209 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	EAF1	Q06337	982 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	RAD4	P14736	754 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	PET10	P36139	283 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	CTF8	P38877	133 aa		5	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	ERP6	P53198	216 aa		5	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
CIK1	YMR198W	ENV7	Q12003	364 aa		5	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	CEP3	P40969	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	CDC11	P32458	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	SPO75	Q07798	868 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	ARE1	P25628	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	MOH1	P38191	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	TAF8	Q03750	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	ERG4	P25340	473 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	SUL1	P38359	859 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	VPS30	Q02948	557 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	PEX19	Q07418	342 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CIK1	YMR198W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	MRPS35	P53292	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	PPM2	Q08282	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	CIT1	P00890	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	CTF13	P35203	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	OAR1	P35731	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	BET3	P36149	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	KTR4	P38131	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	GYP8	P43570	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	TIM54	P47045	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	GIS1	Q03833	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	YHR078W	P38799	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	FLC1	Q08967	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	RTA1	P53047	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	HUL5	P53119	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	TRM11	Q12463	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	YCL002C	P25565	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	EMC3	P36039	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CIK1	YMR198W	TAD1	P53065	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	RNT1	Q02555	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	MUK1	Q02866	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	SWM1	Q12379	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	DAL7	P21826	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	VHR1	P40522	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	ASI2	P53895	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIK1	YMR198W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	ALG7	P07286	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	YJL049W	P47048	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	PUS2	P53167	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	BDF2	Q07442	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	CAN1	P04817	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	RPP1	P38786	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	STB4	P50104	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	OMS1	Q06668	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	ELO3	P40319	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	NIT3	P49954	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	TMN2	Q04562	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	GPR1	Q12361	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	HUL4	P40985	892 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	FKH2	P41813	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	FRE5	Q08908	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	MCH5	Q08777	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	THI21	Q08975	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	YBR053C	P38235	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CIK1	YMR198W	PFA3	P42836	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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