RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	GSY1	P23337	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	AGP1	P25376	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	VMA3	P25515	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	PGS1	P25578	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	UGA4	P32837	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	BEM3	P32873	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SMC1	P32908	1225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	LDH1	P38139	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	PFD1	P46988	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	GIS4	Q04233	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	OPY2	Q06810	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	MDM38	Q08179	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SAC3	P46674	1301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	DRS2	P39524	1355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	QCR6	P00127	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	AEP2	P22136	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	RKM3	P38222	552 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	GIP1	P38229	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	PBY1	P38254	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	NPR3	P38742	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	BCD1	P38772	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	ACA1	P39970	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	ERR3	P42222	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	LSB6	P42951	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	MEP3	P53390	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SHE9	Q04172	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	RSC2	Q06488	889 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	PGC1	Q08959	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	SLP1	Q12232	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	VPS15	P22219	1454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	MYO4	P32492	1471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	STH1	P32597	1359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YRA2	YKL214C	MRP7	P12687	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SAN1	P22470	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	VBA3	P25594	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	FUN30	P31380	1131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PRY1	P47032	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MAL11	P53048	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YRA2	YKL214C	YNR040W	P53736	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SGD1	Q06132	899 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RSC58	Q07979	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	CDC45	Q08032	650 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SPO16	P17122	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RAD51	P25454	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MKK2	P32491	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SEA4	P38164	1038 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	CCC2	P38995	1004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	PIC2	P40035	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	JEM1	P40358	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	XKS1	P42826	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SAE2	P46946	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	NPY1	P53164	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ULP1	Q02724	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ADI1	Q03677	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	ESC8	Q08119	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MCA1	Q08601	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	SSM4	P40318	1319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	RAD18	P10862	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YRA2	YKL214C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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