RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	YCL002C	P25565	263 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	PCL2	P25693	308 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	RPD3	P32561	433 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	MCD4	P36051	919 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	MND2	P40577	368 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	HXT16	P47185	567 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	INP52	P50942	1183 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	HDA1	P53973	706 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	OMA1	P36163	345 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YEN1	P40028	759 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.67	□□□□□ -1.5	not detected
RPC17	YJL011C	HLJ1	P48353	224 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	SPE1	P08432	466 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	MGS1	P40151	587 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	CEP3	P40969	608 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	CAF16	P43569	289 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YKR011C	Q02209	353 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	LRG1	P35688	1017 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	PLB2	Q03674	706 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	THI73	Q07904	523 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPC17	YJL011C	SFL1	P20134	766 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	YEL1	P34225	687 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	ALY2	P47029	1046 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	MET13	P53128	600 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	ROT1	Q03691	256 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	ADY3	Q07732	790 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	DFG16	Q99234	619 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	NUP145	P49687	1317 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	HMG1	P12683	1054 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	MIH1	P23748	554 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.63	□□□□□ -1.51	not detected
RPC17	YJL011C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	HOG1	P32485	435 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	GPG1	P53130	126 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SNO2	P53823	222 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	VPS30	Q02948	557 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	UME1	Q03010	460 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SGD1	Q06132	899 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	TPO1	Q07824	586 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	HAL9	Q12180	1030 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	YOR022C	Q12204	715 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	PMT3	P47190	753 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	YGR237C	P50089	785 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	AIM14	P53109	570 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	ATG33	Q06485	197 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	PRC1	P00729	532 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	CDC6	P09119	513 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	FBP1	P09201	348 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SAP190	P36123	1033 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	POA1	P38218	177 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	GCV2	P49095	1034 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	PUS2	P53167	370 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	MRPL22	P53881	309 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	GUP2	Q08929	609 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	THI21	Q08975	551 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	DIF1	O13577	133 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	LAM1	P38851	1228 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	YDR132C	Q03900	495 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	NHX1	Q04121	633 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	COG8	Q04632	607 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	HMI1	Q12039	706 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	CTF8	P38877	133 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	SHR5	P41912	237 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	CRR1	Q05790	422 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	DUS4	Q06063	367 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPC17	YJL011C	EMC1	P25574	760 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	MEF2	P39677	819 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	MET12	P46151	657 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	YJR096W	P47137	282 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	VPS62	P53285	467 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	GCN5	Q03330	439 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
RPC17	YJL011C	GUD1	Q07729	489 aa		5.58	□□□□□ -1.52

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