RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	POA1	P38218	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MET12	P46151	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	ALG12	P53730	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	YAP6	Q03935	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	RXT3	Q07458	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	SPC29	P33419	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	TOD6	P34219	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	GIP4	P39732	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	HDA1	P53973	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
THP2	YHR167W	HIS5	P07172	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	RPD3	P32561	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
THP2	YHR167W	RAD53	P22216	821 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MEF1	P25039	761 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MSH2	P25847	964 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	THI4	P32318	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	FLR1	P38124	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	CHA4	P43634	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	NIT3	P49954	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	ATP25	Q03153	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MDM12	Q92328	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	TAF2	P23255	1407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	FBP1	P09201	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	PPG1	P32838	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	ATG19	P35193	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	TAD1	P53065	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	DAM1	P53267	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	MET7	Q08645	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
THP2	YHR167W	DAL7	P21826	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	STE14	P32584	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	CEP3	P40969	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
THP2	YHR167W	NCS6	P53088	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	UPC2	Q12151	913 aa		4.83	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	SSN2	P38931	1420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	LST4	P34239	828 aa		4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	HXT16	P47185	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	VPS30	Q02948	557 aa		4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	NTG2	Q08214	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.82	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	YCL002C	P25565	263 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	MTC2	P34246	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	PLB1	P39105	664 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	SDP1	P40479	209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	UGO1	Q03327	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	TMA10	Q06177	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	REH1	Q06709	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	NPC2	Q12408	173 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	HSL1	P34244	1518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	YLR358C	O13565	187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	CDC9	P04819	755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	PER1	P25625	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	CTF8	P38877	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	RSC3	Q06639	885 aa		4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.8	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	KOG1	P38873	1557 aa		4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	STE11	P23561	717 aa		4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	SED4	P25365	1065 aa		4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	PEX6	P33760	1030 aa		4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	DSS1	P39112	969 aa		4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	VBA3	P25594	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	PUS2	P53167	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	THI21	Q08975	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.78	□□□□□ -1.64
THP2	YHR167W	GSY1	P23337	708 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THP2	YHR167W	CTS1	P29029	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THP2	YHR167W	MCD4	P36051	919 aa		4.77	□□□□□ -1.65
THP2	YHR167W	MNN1	P39106	762 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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