RNA–Protein interactions for RNA: YER119C

AVT6, Transcript of Vacuolar aspartate and glutamate exporter, yeast

Gene AVT6, Length 1,347 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT6	YER119C	SEC9	P40357	651 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	CEP3	P40969	608 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	SHE10	P53075	577 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	ESBP6	P53918	673 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	VTC3	Q02725	835 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	POX1	P13711	748 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.22	□□□□□ -0.61	not detected
AVT6	YER119C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	SMC1	P32908	1225 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	XRS2	P33301	854 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	SCS3	P53012	380 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	TAD1	P53065	400 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	OSW2	Q12202	724 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	RAD57	P25301	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	DPH2	P32461	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	HXT1	P32465	570 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	NPP2	P39997	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	YNL146W	P53906	100 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	BOP3	P53958	396 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	VPS60	Q03390	229 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	YML020W	Q03722	664 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	SML1	Q04964	104 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	DAS2	Q12084	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AVT6	YER119C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	STE11	P23561	717 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	HXT8	P40886	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	VAC14	Q06708	880 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ICL2	Q12031	575 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	MCM16	Q12262	181 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SRF1	Q12516	437 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	FLR1	P38124	548 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	MMM1	P41800	426 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	JJJ3	P47138	172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	CUL3	P53202	744 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ENV11	P53246	860 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ECM7	Q06200	448 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	HFI1	Q12060	488 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	HIF1	Q12373	385 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	YDL206W	Q12424	762 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	MAS2	P11914	482 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	CKI1	P20485	582 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	KIP1	P28742	1111 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SRB4	P32569	687 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	RAD54	P32863	898 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	BUD16	P39988	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.18	□□□□□ -0.62	RIP-Chip
AVT6	YER119C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ECM29	P38737	1868 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.17	□□□□□ -0.62	not detected
AVT6	YER119C	JNM1	P36224	373 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	TCD1	P38756	429 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	NDC80	P40460	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SOV1	Q04748	898 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	DPB3	P27344	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	YEL043W	P32618	956 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	TMT1	P32643	299 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	GPT2	P36148	743 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ORC5	P50874	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	MAL13	P53338	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	NGL3	Q03210	505 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SLX4	Q12098	748 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SNA3	P14359	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	AFT1	P22149	690 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	PRY3	P47033	881 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	ACF4	P47129	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	YGR021W	P53212	290 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	YDR090C	Q03193	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	MSC2	Q03455	724 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	SFI1	Q12369	946 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AVT6	YER119C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SWI3	P32591	825 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	FTR1	P40088	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.14	□□□□□ -0.63	not detected
AVT6	YER119C	VPS70	P47161	811 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	BTN2	P53286	410 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SIL1	Q08199	421 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	GIS3	Q12418	502 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	MMS4	P38257	691 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AVT6	YER119C	VID24	P38263	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms