RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0297	Q0297	FMP10	P40098	244 aa		19	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	TCO89	Q08921	799 aa		19	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	TRK2	P28584	889 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	MMS4	P38257	691 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	BUD16	P39988	312 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	YOR022C	Q12204	715 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	MED1	Q12321	566 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	AIM44	Q99299	758 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	TRS33	Q99394	268 aa		18.99	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	OM45	P16547	393 aa		18.98	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	TOS3	P43637	560 aa		18.98	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	MET13	P53128	600 aa		18.98	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	IDI1	P15496	288 aa		18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	ADK2	P26364	225 aa		18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	ISM1	P48526	1002 aa		18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	PNG1	Q02890	363 aa		18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	HEH2	Q03281	663 aa		18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	AFT2	Q08957	416 aa		18.97	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	PRC1	P00729	532 aa		18.96	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.96	■□□□□ 0.63	not detected
Q0297	Q0297	MRPL7	P36519	292 aa		18.96	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	LSC2	P53312	427 aa		18.96	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
Q0297	Q0297	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	PRR1	P28708	518 aa		18.94	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	PSO2	P30620	661 aa		18.94	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	MLH2	Q07980	695 aa		18.94	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	YOL075C	Q08234	1294 aa		18.94	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	MSP1	P28737	362 aa		18.93	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	YER186C	P40101	306 aa		18.93	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	OSH2	Q12451	1283 aa		18.93	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	XDJ1	P39102	459 aa		18.92	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	NPP2	P39997	493 aa		18.92	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	CHS2	P14180	963 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	URK1	P27515	501 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	TRM2	P33753	639 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	HEL1	P36113	551 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	YHR202W	P38887	602 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	LCB2	P40970	561 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	YGR237C	P50089	785 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	INP52	P50942	1183 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	ESC8	Q08119	714 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		18.91	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.9	■□□□□ 0.62	not detected
Q0297	Q0297	RRM3	P38766	723 aa		18.9	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	BCD1	P38772	366 aa		18.9	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	TIM8	P57744	87 aa		18.9	■□□□□ 0.62
Q0297	Q0297	NPR3	P38742	1146 aa		18.89	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	SPO71	Q03868	1245 aa		18.89	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	MNR2	P35724	969 aa		18.88	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	CCL1	P37366	393 aa		18.88	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	ULI1	P43604	169 aa		18.88	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	DON1	Q05610	365 aa		18.88	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	GSY2	P27472	705 aa		18.87	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	IME2	P32581	645 aa		18.87	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	RPN12	P32496	274 aa		18.86	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	YFL052W	P43551	465 aa		18.86	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	STB4	P50104	949 aa		18.86	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	CIT2	P08679	460 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	ASP3-2	P0CX77	362 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	ASP3-3	P0CX78	362 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	ASP3-4	P0CX79	362 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	POL3	P15436	1097 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	YGR130C	P53278	816 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	EEB1	Q02891	456 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	REC8	Q12188	680 aa		18.85	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	UBP5	P39944	805 aa		18.84	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	SDH5	Q08230	162 aa		18.84	■□□□□ 0.61
Q0297	Q0297	YMR084W	A2P2R3	262 aa		18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	BIO2	P32451	375 aa		18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	RAD54	P32863	898 aa		18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49 ms