RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA WHI4Q07655 649 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA HBN1Q96VH4 193 aa4.21□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA CDC48P25694 835 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA AFR1P33304 620 aa4.2□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA BUL2Q03758 920 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA NPP1P25353 742 aa4.19□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA PET10P36139 283 aa4.19□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA OSW7P43611 510 aa4.19□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA YKE2P52553 114 aa4.19□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA PPM2Q08282 695 aa4.19□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA NPC2Q12408 173 aa4.19□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA CAN1P04817 590 aa4.18□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA RPP2AP05319 106 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA REC104P33323 182 aa4.18□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA BUD6P41697 788 aa4.18□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA NCS6P53088 359 aa4.18□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA YPR071WQ12346 211 aa4.18□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA HSF1P10961 833 aa4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA PFK1P16861 987 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA YBR284WP38150 797 aa4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data4.17□□□□□ -1.74not detected
15S_rRNA15S_rRNA TOK1P40310 691 aa4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA UBP6P43593 499 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA ORC1P54784 914 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA YPR196WQ06595 470 aa4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA HRR25P29295 494 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA URM1P40554 99 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA BUL1P48524 976 aa4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA TOM70P07213 617 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA TOP3P13099 656 aa4.16□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA BET3P36149 193 aa4.16□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA KAR4P25583 335 aa4.15□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA ATG19P35193 415 aa4.15□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA RTA1P53047 317 aa4.15□□□□□ -1.74
15S_rRNA15S_rRNA ERT1P38140 529 aa4.14□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA RAI1P53063 387 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA VPS30Q02948 557 aa4.14□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA AIM39Q08223 395 aa4.14□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA YLR125WQ12138 136 aa4.14□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA NOT3P06102 836 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA CIT2P08679 460 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA TIM23P32897 222 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA NUP82P40368 713 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA NIT3P49954 291 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA UPC2Q12151 913 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA MPH2P0CD99 609 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA RFA1P22336 621 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA STE14P32584 239 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA ALG2P43636 503 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA ENB1Q08299 606 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA ENV7Q12003 364 aa4.13□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA ERR1P0CX10 437 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA ERR2P0CX11 437 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA PHO8P11491 566 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA STE13P33894 931 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA OAR1P35731 278 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA EMC3P36039 253 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA MOH1P38191 138 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data4.12□□□□□ -1.75not detected
15S_rRNA15S_rRNA DAM1P53267 343 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA SLU7Q02775 382 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA YLR040CQ07988 224 aa4.12□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA URA1P28272 314 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA GDH3P39708 457 aa4.11□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA NOG2P53742 486 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA RRP14P36080 434 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA UBA2P52488 636 aa4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA TYE7P33122 291 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA NMD2P38798 1089 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA GYP8P43570 497 aa4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA HSV2P50079 448 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA YKR011CQ02209 353 aa4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA ATP25Q03153 612 aa4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA REH1Q06709 432 aa4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA TRM13Q12383 476 aa4.1□□□□□ -1.75
15S_rRNA15S_rRNA RPS9AO13516 197 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data4.09□□□□□ -1.76not detected
15S_rRNA15S_rRNA SPC29P33419 253 aa4.09□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA POB3Q04636 552 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA YOL073CQ08232 322 aa4.09□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA GUP2Q08929 609 aa4.09□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA MET6P05694 767 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA FBP1P09201 348 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA THI4P32318 326 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA SUL1P38359 859 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA CEP3P40969 608 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA MAL11P53048 616 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA RNH70P53331 553 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA HDA1P53973 706 aa4.08□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA SED4P25365 1065 aa4.07□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA MSH2P25847 964 aa4.07□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA RPD3P32561 433 aa4.07□□□□□ -1.76
15S_rRNA15S_rRNA PPG1P32838 368 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms