RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	FAR11	P53917	953 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	OXR1	Q08952	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RRN11	YML043C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SCD5	P34758	872 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	BDH2	P39713	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	IOC3	P43596	787 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YJL049W	P47048	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HST1	P53685	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CTF4	Q01454	927 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	FUS2	Q05670	677 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PMT7	Q06644	662 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	BUD7	Q08754	746 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YIG1	Q08956	461 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PPG1	P32838	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PNG1	Q02890	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YML108W	Q03759	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MET7	Q08645	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SWC3	P31376	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PPH3	P32345	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NIP100	P33420	868 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NUP120	P35729	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RGD1	P38339	666 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HXT8	P40886	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
RRN11	YML043C	BFA1	P47113	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ECL1	P48235	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YGL081W	P53156	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	YNL058C	P53947	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RSC4	Q02206	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
RRN11	YML043C	PLP1	Q04004	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MMR1	Q06324	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	GNT1	Q12096	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	PET122	P10355	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	OPI1	P21957	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	VMA3	P25515	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ACP1	P32463	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ECM4	P36156	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SAK1	P38990	1142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SYG1	P40528	902 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	LSB6	P42951	607 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CWC24	P53769	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	RTC4	P53850	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	BET4	Q00618	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NSE3	Q05541	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	BSC2	Q05611	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MCA1	Q08601	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CIT2	P08679	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	ADH4	P10127	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
RRN11	YML043C	TUP1	P16649	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	SEN2	P16658	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CLB4	P24871	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	HCS1	P34243	683 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	BLI1	P35727	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MRPL10	P36520	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	LDH1	P38139	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	MUM2	P38236	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRN11	YML043C	APD1	P38281	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.9 ms