RNA–Protein interactions for RNA: YLR298C

YHC1, Transcript of Component of the U1 snRNP complex required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YHC1, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC1	YLR298C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	ESC2	Q06340	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	KAR4	P25583	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	UBA2	P52488	636 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	SPO20	Q04359	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	SFB2	P53953	876 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	HEM3	P28789	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	ATG19	P35193	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
YHC1	YLR298C	YML020W	Q03722	664 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	GUP2	Q08929	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	SUL1	P38359	859 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	UPC2	Q12151	913 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	MNR2	P35724	969 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHC1	YLR298C	ASF1	P32447	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
YHC1	YLR298C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	YGR053C	P53234	283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	TMN2	Q04562	672 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	ERG4	P25340	473 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	RPC82	P32349	654 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	STE14	P32584	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	KTR4	P38131	464 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	MBP1	P39678	833 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	OMS1	Q06668	471 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	MCH5	Q08777	521 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	GYP7	P48365	746 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	STB4	P50104	949 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	TRM13	Q12383	476 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	SED4	P25365	1065 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	YER158C	P40095	573 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	ATF1	P40353	525 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	MUK1	Q02866	612 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YHC1	YLR298C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YHC1	YLR298C	STU2	P46675	888 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	ERG5	P54781	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	RNT1	Q02555	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	ACF2	Q12168	779 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	AGP1	P25376	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	IRC10	Q08118	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	NPP1	P25353	742 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	ALG7	P07286	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	YKE2	P52553	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	AFR1	P33304	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	MTH1	P35198	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	VBA5	P36172	582 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	TIM44	Q01852	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	STE13	P33894	931 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	GND2	P53319	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	FBP1	P09201	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	PPH3	P32345	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	YKL069W	P36088	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	PEX19	Q07418	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	BDF2	Q07442	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YHC1	YLR298C	RPD3	P32561	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	SPC42	P36094	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	SDP1	P40479	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	VPS16	Q03308	798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	SHE9	Q04172	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	CLN2	P20438	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	CTF13	P35203	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	ERT1	P38140	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	SDS3	P40505	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	OPI10	Q08202	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YHC1	YLR298C	FRE5	Q08908	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms