RNA–Protein interactions for RNA: YHR010W

RPL27A, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L27A, yeast

Gene RPL27A, Length 411 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL27A	YHR010W	SPE1	P08432	466 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	HSF1	P10961	833 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	MRP8	P35719	219 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	SFB2	P53953	876 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	HCM1	P25364	564 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	RPC82	P32349	654 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	DCG1	P32460	244 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	TRM2	P33753	639 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	GYP7	P48365	746 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL27A	YHR010W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PBY1	P38254	753 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	CCC2	P38995	1004 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	IRR1	P40541	1150 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	NTO1	Q12311	748 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	STE5	P32917	917 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YER158C	P40095	573 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PHO23	P50947	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	NPP1	P25353	742 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	AFR1	P33304	620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	EXG2	P52911	562 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PUS9	Q12069	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	ATG19	P35193	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	SIT1	P39980	628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YKE2	P52553	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	NCS6	P53088	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PPH3	P32345	308 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YBR184W	P38299	523 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	IOC3	P43596	787 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PFD1	P46988	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	ADE8	P04161	214 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	MSE1	P48525	536 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	SUN4	P53616	420 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	NPC2	Q12408	173 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PNS1	Q12412	539 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL27A	YHR010W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	TPO2	P53283	614 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	YRO2	P38079	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	SLI1	P53304	468 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	FMP25	Q08023	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	UPC2	Q12151	913 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	LAS17	Q12446	633 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	ERT1	P38140	529 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	MSS4	P38994	779 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	AIM21	P40563	679 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	ENB1	Q08299	606 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	DNA2	P38859	1522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	STE14	P32584	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	GUP2	Q08929	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	KAR4	P25583	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	STE13	P33894	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	CHS7	P38843	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	TOK1	P40310	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	ALR2	P43553	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	KIN4	Q01919	800 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	LCD1	Q04377	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL27A	YHR010W	FBP1	P09201	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SED4	P25365	1065 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	BUL1	P48524	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	CDC11	P32458	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	REC104	P33323	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	YBR284W	P38150	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	ERP6	P53198	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	CTF4	Q01454	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	EAF1	Q06337	982 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	UBX5	Q06682	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	SPO75	Q07798	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	AIM39	Q08223	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL27A	YHR010W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms