RNA–Protein interactions for RNA: Q0110

BI2, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase with a role in splicing, yeast

Gene BI2, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI2	Q0110	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BI2	Q0110	HOF1	Q05080	669 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BI2	Q0110	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
BI2	Q0110	YLL058W	Q12198	575 aa		5.04	□□□□□ -1.6
BI2	Q0110	SDS3	P40505	327 aa		5.03	□□□□□ -1.6
BI2	Q0110	SRT1	Q03175	343 aa		5.02	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	FUN30	P31380	1131 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	YAP7	Q08182	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	UPC2	Q12151	913 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
BI2	Q0110	TRM13	Q12383	476 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	MDM10	P18409	493 aa		5	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	YKL151C	P36059	337 aa		5	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	HRQ1	Q05549	1077 aa		5	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	RTT10	Q08924	1013 aa		5	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	ICT1	Q12385	394 aa		5	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	SEC20	P28791	383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	GIC1	P38785	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	SED4	P25365	1065 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	PPZ2	P33329	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	COQ11	Q05892	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	IMO32	P53219	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BI2	Q0110	BNR1	P40450	1375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	YHL017W	P38745	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	DAS1	P47005	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	INO1	P11986	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	LYP1	P32487	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	SUT2	Q12286	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	RKM4	Q12504	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	STE14	P32584	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	PPS1	P38148	807 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	ERG5	P54781	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	YPL066W	Q12194	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	RPC82	P32349	654 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	TDP1	P38319	544 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	YGL176C	P46945	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	FRE5	Q08908	694 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	MCM2	P29469	868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	TMT1	P32643	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	YKL107W	P34251	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	IPL1	P38991	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	TAF7	Q05021	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI2	Q0110	MET3	P08536	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	NPP2	P39997	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	SFB2	P53953	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
BI2	Q0110	PEX19	Q07418	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	MGE1	P38523	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	TYW3	P53177	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	SEC5	P89102	971 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	ELO3	P40319	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	DLT1	Q04216	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	SPR28	Q04921	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	TAH11	P47112	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	GLO1	P50107	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	YPR196W	Q06595	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	CDC43	P18898	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	FLO10	P36170	1169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	ADY4	Q05955	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	CTF13	P35203	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	THI7	Q05998	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	EEB1	Q02891	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BI2	Q0110	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	ARO10	Q06408	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	TRM11	Q12463	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	GYP7	P48365	746 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	SPO20	Q04359	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	DUT1	P33317	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	YIL166C	P40445	542 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	KIN3	P22209	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
BI2	Q0110	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	SLD2	P34252	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	PCL5	P38794	229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	FYV10	P40492	516 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	SWM1	Q12379	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	SDP1	P40479	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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