RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zap70P43404 618 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc146E9Q9F7 977 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MpndQ3TV65 487 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp8b2P98199 1209 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nek4Q9Z1J2 792 aa28.54■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HellsQ60848 821 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg4aQ8C9S8 396 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa28.52■■■□□ 2.16
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nphp1Q9QY53 687 aa28.51■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MypnQ5DTJ9 1315 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarcc1P97496 1104 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q8BT18 775 aa28.5■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mmp8O70138 465 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vars2Q3U2A8 1060 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srgap3Q812A2 1099 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Htatsf1Q8BGC0 757 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slfnl1Q8BHW9 410 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm13023A2A8N2 498 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Map3k13Q1HKZ5 959 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Snapc4Q8BP86 1333 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx58Q6Q899 926 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prr5lA2AVJ5 370 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankrd13dQ6PD24 605 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.43■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mcmdc2E9Q956 681 aa28.41■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppp6r3Q922D4 844 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Terf2O35144 541 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fkbp5Q64378 456 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa28.4■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AK157302I3ITR1 129 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pim2Q62070 370 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Isca1Q9D924 129 aa28.39■■■□□ 2.14
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zkscan2G3X952 960 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ArxO35085 564 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grm8P47743 908 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cwc27Q3TKY6 469 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ripor2Q80U16 1078 aa28.39■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ssc5dQ8BV57 1371 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adam1aQ60813 791 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prr29B1ARI9 187 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 C4bP01029 1738 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ank1Q02357 1862 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Strn4P58404 760 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NmiO35309 314 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrrc43Q3V0L5 667 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Esco1Q69Z69 843 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AbraQ8BUZ1 375 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tlr7P58681 1050 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trip6Q9Z1Y4 480 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ier5O89113 308 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Soga3Q6NZL0 945 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnf123Q5XPI3 1314 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.34■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myd88P22366 296 aa28.33■■■□□ 2.13
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Catsper2A2ARP9 588 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mum1Q6DID5 682 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rgs17Q9QZB0 210 aa28.32■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cwc25Q9DBF7 416 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcar3Q9QZK2 820 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slf2Q6P9P0 1278 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GorabQ8BRM2 368 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ehd4Q9EQP2 541 aa28.31■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stard3nlQ9DCI3 235 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrc1Q61830 1456 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dpf1Q9QX66 387 aa28.29■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc6D3YZP9 469 aa28.28■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp1b3P97370 278 aa28.28■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DaxxO35613 739 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tgfb1i1Q62219 461 aa28.27■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9D2X8 372 aa28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67.6 ms