Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,15■■■■■ 5,14
Tlr7P58681 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,5■■■■■ 4,55
Tlr7P58681 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Tlr7P58681 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
Tlr7P58681 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,42■■■■■ 4,22
Tlr7P58681 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Tlr7P58681 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,82■■■■■ 4,13
Tlr7P58681 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,64■■■■■ 4,1
Tlr7P58681 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Tlr7P58681 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Tlr7P58681 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Tlr7P58681 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Tlr7P58681 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,32■■■■□ 3,89
Tlr7P58681 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Tlr7P58681 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Tlr7P58681 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39■■■■□ 3,83
Tlr7P58681 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,89■■■■□ 3,82
Tlr7P58681 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Tlr7P58681 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Tlr7P58681 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Tlr7P58681 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Tlr7P58681 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Tlr7P58681 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Tlr7P58681 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Tlr7P58681 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,14■■■■□ 3,7
Tlr7P58681 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Tlr7P58681 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38,09■■■■□ 3,69
Tlr7P58681 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Tlr7P58681 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38■■■■□ 3,67
Tlr7P58681 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Tlr7P58681 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Tlr7P58681 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Tlr7P58681 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Tlr7P58681 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Tlr7P58681 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Tlr7P58681 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Tlr7P58681 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Tlr7P58681 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Tlr7P58681 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Tlr7P58681 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,19■■■■□ 3,54
Tlr7P58681 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Tlr7P58681 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Tlr7P58681 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Tlr7P58681 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Tlr7P58681 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,7■■■■□ 3,46
Tlr7P58681 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Tlr7P58681 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Tlr7P58681 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Tlr7P58681 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Tlr7P58681 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Tlr7P58681 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Tlr7P58681 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Tlr7P58681 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,37■■■■□ 3,41
Tlr7P58681 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Tlr7P58681 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Tlr7P58681 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Tlr7P58681 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Tlr7P58681 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Tlr7P58681 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Tlr7P58681 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Tlr7P58681 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
Tlr7P58681 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Tlr7P58681 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Tlr7P58681 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Tlr7P58681 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Tlr7P58681 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Tlr7P58681 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Tlr7P58681 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Tlr7P58681 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Tlr7P58681 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,76■■■■□ 3,31
Tlr7P58681 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Tlr7P58681 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Tlr7P58681 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Tlr7P58681 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Tlr7P58681 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Tlr7P58681 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Tlr7P58681 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Tlr7P58681 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Tlr7P58681 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Tlr7P58681 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Tlr7P58681 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Tlr7P58681 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Tlr7P58681 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Tlr7P58681 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Tlr7P58681 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Tlr7P58681 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Tlr7P58681 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Tlr7P58681 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Tlr7P58681 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Tlr7P58681 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Tlr7P58681 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Tlr7P58681 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Tlr7P58681 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Tlr7P58681 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Tlr7P58681 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Tlr7P58681 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Tlr7P58681 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Tlr7P58681 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Tlr7P58681 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Tlr7P58681 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms