Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Tlr7P58681 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Tlr7P58681 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Tlr7P58681 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Tlr7P58681 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Tlr7P58681 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Tlr7P58681 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
Tlr7P58681 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Tlr7P58681 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Tlr7P58681 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Tlr7P58681 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Tlr7P58681 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Tlr7P58681 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Tlr7P58681 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Tlr7P58681 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Tlr7P58681 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Tlr7P58681 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Tlr7P58681 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Tlr7P58681 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Tlr7P58681 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Tlr7P58681 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Tlr7P58681 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Tlr7P58681 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Tlr7P58681 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Tlr7P58681 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Tlr7P58681 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Tlr7P58681 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Tlr7P58681 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Tlr7P58681 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Tlr7P58681 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Tlr7P58681 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Tlr7P58681 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Tlr7P58681 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Tlr7P58681 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Tlr7P58681 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Tlr7P58681 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Tlr7P58681 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Tlr7P58681 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Tlr7P58681 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tlr7P58681 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Tlr7P58681 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tlr7P58681 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Tlr7P58681 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Tlr7P58681 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tlr7P58681 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Tlr7P58681 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tlr7P58681 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tlr7P58681 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tlr7P58681 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tlr7P58681 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Tlr7P58681 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tlr7P58681 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Tlr7P58681 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Tlr7P58681 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Tlr7P58681 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Tlr7P58681 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Tlr7P58681 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Tlr7P58681 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Tlr7P58681 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Tlr7P58681 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Tlr7P58681 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Tlr7P58681 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tlr7P58681 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tlr7P58681 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Tlr7P58681 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Tlr7P58681 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tlr7P58681 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Tlr7P58681 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Tlr7P58681 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Tlr7P58681 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Tlr7P58681 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Tlr7P58681 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Tlr7P58681 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Tlr7P58681 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Tlr7P58681 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Tlr7P58681 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tlr7P58681 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tlr7P58681 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Tlr7P58681 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tlr7P58681 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Tlr7P58681 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Tlr7P58681 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tlr7P58681 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Tlr7P58681 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Tlr7P58681 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tlr7P58681 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Tlr7P58681 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Tlr7P58681 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tlr7P58681 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tlr7P58681 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tlr7P58681 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Tlr7P58681 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Tlr7P58681 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Tlr7P58681 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tlr7P58681 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tlr7P58681 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tlr7P58681 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Tlr7P58681 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tlr7P58681 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Tlr7P58681 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms