RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NmiO35309 314 aa22.61■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa22.61■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cwc25Q9DBF7 416 aa22.61■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa22.6■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nphp1Q9QY53 687 aa22.6■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col22a1E9Q7P1 1613 aa22.6■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mmp8O70138 465 aa22.59■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myd88P22366 296 aa22.59■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q8BT18 775 aa22.59■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stard3nlQ9DCI3 235 aa22.59■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.59■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm13023A2A8N2 498 aa22.58■■□□□ 1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 InsrrQ9WTL4 1300 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cgnl1Q6AW69 1298 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slfnl1Q8BHW9 410 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cetn4Q8K4K1 168 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plch1Q4KWH5 1682 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Greb1lB9EJV3 1913 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tgfb1i1Q62219 461 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlrp9bQ66X22 1003 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Esco1Q69Z69 843 aa22.57■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aldh8a1Q8BH00 487 aa22.56■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myh1Q5SX40 1942 aa22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vars2Q3U2A8 1060 aa22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc43Q3V0L5 667 aa22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gnat3Q3V3I2 354 aa22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adam1aQ60813 791 aa22.55■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa22.54■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Strn4P58404 760 aa22.54■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.54■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam213aQ9CYH2 218 aa22.54■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ubr3Q5U430 1889 aa22.54■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slf2Q6P9P0 1278 aa22.53■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 FanclQ9CR14 375 aa22.53■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gcc1Q9D4H2 778 aa22.53■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 VgfQ0VGU4 617 aa22.52■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd13dQ6PD24 605 aa22.52■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim30dE9PWL0 497 aa22.52■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mcmdc2E9Q956 681 aa22.52■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Map7O88735 730 aa22.52■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GpkowQ56A08 488 aa22.52■■□□□ 1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Snapc4Q8BP86 1333 aa22.51■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dpf1Q9QX66 387 aa22.51■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc27Q3V036 639 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atg4aQ8C9S8 396 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trip6Q9Z1Y4 480 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa22.49■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pnmal2G3X9N3 661 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mcm2P97310 904 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp1b3P97370 278 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ipo8Q7TMY7 1010 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SowahdQ8BY98 327 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif18aQ91WD7 886 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col11a2Q64739 1736 aa22.48■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc183A2AJB1 534 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pim2Q62070 370 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NexnQ7TPW1 607 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Smc4Q8CG47 1286 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmc1Q8R4P5 757 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim34aQ99PP6 485 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc4E9Q236 1325 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfyve9A2A8R0 1397 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Snai1Q02085 264 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clca2Q8BG22 942 aa22.47■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp19a1P28649 503 aa22.46■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ifit1bl2Q3U687 466 aa22.46■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adora1Q60612 326 aa22.46■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttc19Q8CC21 365 aa22.46■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem87bQ8BKU8 555 aa22.45■■□□□ 1.19
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc146E9Q9F7 977 aa22.45■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.45■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AtrnQ9WU60 1428 aa22.45■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ildr2B5TVM2 661 aa22.44■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GptQ8QZR5 496 aa22.43■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ak7Q9D2H2 614 aa22.43■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cct4P80315 539 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zbtb3Q91X45 518 aa22.42■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxo4Q9WVH3 505 aa22.42■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa22.42■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr63B2RY71 923 aa22.41■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prl3d2F6R3P9 224 aa22.41■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hoxa7P02830 229 aa22.41■■□□□ 1.18
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CanxP35564 591 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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