Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
Snai1Q02085 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Snai1Q02085 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Snai1Q02085 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Snai1Q02085 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
Snai1Q02085 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
Snai1Q02085 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Snai1Q02085 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Snai1Q02085 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Snai1Q02085 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Snai1Q02085 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Snai1Q02085 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Snai1Q02085 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Snai1Q02085 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Snai1Q02085 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Snai1Q02085 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Snai1Q02085 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Snai1Q02085 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Snai1Q02085 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Snai1Q02085 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Snai1Q02085 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Snai1Q02085 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Snai1Q02085 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Snai1Q02085 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Snai1Q02085 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Snai1Q02085 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Snai1Q02085 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Snai1Q02085 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Snai1Q02085 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Snai1Q02085 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Snai1Q02085 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Snai1Q02085 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Snai1Q02085 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Snai1Q02085 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Snai1Q02085 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Snai1Q02085 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Snai1Q02085 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Snai1Q02085 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Snai1Q02085 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Snai1Q02085 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Snai1Q02085 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Snai1Q02085 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Snai1Q02085 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Snai1Q02085 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Snai1Q02085 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Snai1Q02085 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Snai1Q02085 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Snai1Q02085 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Snai1Q02085 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Snai1Q02085 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Snai1Q02085 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Snai1Q02085 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Snai1Q02085 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Snai1Q02085 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Snai1Q02085 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Snai1Q02085 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Snai1Q02085 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Snai1Q02085 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Snai1Q02085 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Snai1Q02085 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Snai1Q02085 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Snai1Q02085 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Snai1Q02085 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Snai1Q02085 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Snai1Q02085 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Snai1Q02085 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Snai1Q02085 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Snai1Q02085 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Snai1Q02085 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Snai1Q02085 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Snai1Q02085 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Snai1Q02085 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Snai1Q02085 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Snai1Q02085 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Snai1Q02085 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Snai1Q02085 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Snai1Q02085 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Snai1Q02085 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Snai1Q02085 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Snai1Q02085 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Snai1Q02085 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Snai1Q02085 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Snai1Q02085 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Snai1Q02085 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Snai1Q02085 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Snai1Q02085 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Snai1Q02085 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Snai1Q02085 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Snai1Q02085 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Snai1Q02085 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Snai1Q02085 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Snai1Q02085 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Snai1Q02085 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Snai1Q02085 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Snai1Q02085 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Snai1Q02085 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Snai1Q02085 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Snai1Q02085 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Snai1Q02085 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Snai1Q02085 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms