RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa38.99■■■■□ 3.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NischQ80TM9 1593 aa38.77■■■■□ 3.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc9P70170 1546 aa37.68■■■■□ 3.62
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc8B2RUS7 1588 aa37.2■■■■□ 3.55
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ScribQ80U72 1612 aa35.38■■■■□ 3.25
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dcaf1Q80TR8 1506 aa34.57■■■■□ 3.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdm5dQ62240 1548 aa34.4■■■■□ 3.1
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NacadQ5SWP3 1504 aa34.3■■■■□ 3.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rhox8Q6VSS7 320 aa34.29■■■■□ 3.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa33.92■■■■□ 3.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc180J3QNE4 1664 aa33.73■■■□□ 2.99
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sycp2Q9CUU3 1500 aa33.59■■■□□ 2.97
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Baz1aO88379 1555 aa33.5■■■□□ 2.95
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rtl1Q7M732 1744 aa33.18■■■□□ 2.9
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Crybg2B7ZCC2 1516 aa33.17■■■□□ 2.9
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BicraF8VPZ9 1578 aa32.99■■■□□ 2.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Smarca2Q6DIC0 1577 aa32.64■■■□□ 2.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa32.03■■■□□ 2.72
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa31.89■■■□□ 2.7
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa31.59■■■□□ 2.65
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Synj1Q8CHC4 1574 aa31.59■■■□□ 2.65
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa31.56■■■□□ 2.64
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CftrP26361 1476 aa31.51■■■□□ 2.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim41Q5NCC3 630 aa31.49■■■□□ 2.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.46■■■□□ 2.63
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ercc6F8VPZ5 1481 aa31.21■■■□□ 2.59
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.17■■■□□ 2.58
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Frmpd1A2AKB4 1549 aa31.07■■■□□ 2.57
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Golga3P55937 1487 aa30.94■■■□□ 2.54
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Top2bQ64511 1612 aa30.88■■■□□ 2.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.86■■■□□ 2.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa30.79■■■□□ 2.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.75■■■□□ 2.51
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cngb1E1AZ71 1325 aa30.69■■■□□ 2.5
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
Cbx1-201ENSMUST00000018810 HrcG5E8J6 738 aa30.58■■■□□ 2.49
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TnnQ80Z71 1560 aa30.42■■■□□ 2.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lamc3Q9R0B6 1581 aa30.42■■■□□ 2.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fmn1Q05860 1466 aa30.41■■■□□ 2.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Baz1bQ9Z277 1479 aa30.39■■■□□ 2.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa30.33■■■□□ 2.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep164Q5DU05 1446 aa30.24■■■□□ 2.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif15Q6P9L6 1387 aa30.23■■■□□ 2.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ubl4bQ9CQ84 188 aa30.2■■■□□ 2.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chic1Q8CBW7 227 aa30.14■■■□□ 2.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cux2P70298 1426 aa30■■■□□ 2.39
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Camsap1A2AHC3 1581 aa30■■■□□ 2.39
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mrc2Q64449 1479 aa29.99■■■□□ 2.39
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc18Q640L5 1455 aa29.91■■■□□ 2.38
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.7■■■□□ 2.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il27Q8K3I6 234 aa29.66■■■□□ 2.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Grin2bQ01097 1482 aa29.63■■■□□ 2.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gab3Q8BSM5 595 aa29.56■■■□□ 2.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NrkQ9R0G8 1455 aa29.55■■■□□ 2.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa29.51■■■□□ 2.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Shroom4Q1W617 1475 aa29.48■■■□□ 2.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Crocc2F6XLV1 1638 aa29.43■■■□□ 2.3
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtprkP35822 1457 aa29.4■■■□□ 2.3
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Duox2A2AQ99 1517 aa29.39■■■□□ 2.29
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.34■■■□□ 2.29
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Efcab5A0JP43 1406 aa29.33■■■□□ 2.29
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Samd9lQ69Z37 1561 aa29.26■■■□□ 2.27
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep162Q6ZQ06 1403 aa29.25■■■□□ 2.27
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Npm2Q80W85 207 aa29.24■■■□□ 2.27
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plb1Q3TTY0 1478 aa29.16■■■□□ 2.26
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap35Q91YM2 1499 aa29.15■■■□□ 2.26
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Map3k1P53349 1493 aa29.13■■■□□ 2.25
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa29.1■■■□□ 2.25
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SynmQ70IV5 1561 aa29.06■■■□□ 2.24
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ift140E9PY46 1464 aa29.01■■■□□ 2.23
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rad54l2Q99NG0 1466 aa28.94■■■□□ 2.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zeb1Q64318 1117 aa28.93■■■□□ 2.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Setd1bQ8CFT2 1985 aa28.92■■■□□ 2.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Disp1Q3TDN0 1521 aa28.91■■■□□ 2.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Magi3Q9EQJ9 1476 aa28.89■■■□□ 2.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpatch8A2A6A1 1505 aa28.88■■■□□ 2.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myt1lP97500 1187 aa28.86■■■□□ 2.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Grin2aP35436 1464 aa28.84■■■□□ 2.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pla2r1Q62028 1487 aa28.83■■■□□ 2.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Carmil1Q6EDY6 1374 aa28.82■■■□□ 2.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clip1Q922J3 1391 aa28.81■■■□□ 2.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
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