RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A FMP30Q02883 468 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A PKH1Q03407 766 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A RSC3Q06639 885 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A MCD1Q12158 566 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A ACF2Q12168 779 aa1.15□□□□□ -2.22
YPL060C-AYPL060C-A INO1P11986 533 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SUV3P32580 737 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A VPS35P34110 944 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A OAR1P35731 278 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A APM1Q00776 475 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ULP1Q02724 621 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A LPX1Q12405 387 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data1.15□□□□□ -2.23not detected
YPL060C-AYPL060C-A SCO2P38072 301 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RPS26AP39938 119 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RPS26BP39939 119 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A PHO23P50947 330 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ROD1Q02805 837 aa1.15□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A MET6P05694 767 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A STE11P23561 717 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YPT53P36019 220 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A DOT6P40059 670 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CTF4Q01454 927 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CMR1Q12510 522 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CAF20P12962 161 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A PET112P33893 541 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YFL052WP43551 465 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A HOF1Q05080 669 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CDC11P32458 415 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A POL32P47110 350 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A PEX19Q07418 342 aa1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SUB2Q07478 446 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A VMA4P22203 233 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RSP5P39940 809 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A MTR3P48240 250 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A NRG1Q03125 231 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A DLT1Q04216 342 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-DR6P0CX70 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-ER1P0CX71 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-LR2P0CX72 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-PLP0CX73 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-JR1P0CX74 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-LR3P0CX75 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-ML2P0CX76 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TDP1P38319 544 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RGD1P38339 666 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A NUT2Q06213 157 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ESF1Q06344 628 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-GR1Q12085 440 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YDL177CQ12257 170 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A NTO1Q12311 748 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A OSH2Q12451 1283 aa1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CNN1P43618 361 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SCS3P53012 380 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YGR012WP53206 393 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A GPI13Q07830 1017 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A XYL2Q07993 356 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TMA46Q12000 345 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YKR075CP36155 307 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YGL176CP46945 554 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data1.12□□□□□ -2.23not detected
YPL060C-AYPL060C-A NOB1Q08444 459 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SGO1Q08490 590 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A HOM2P13663 365 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A NAP1P25293 417 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A MCM2P29469 868 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A EFT1P32324 842 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A UGA2P38067 497 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SEA4P38164 1038 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RIM4P38741 713 aa1.12□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A REV7P38927 245 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RNT1Q02555 471 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ADI1Q03677 179 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CIT2P08679 460 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A PRI2P20457 528 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A XBP1P40489 647 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A GND2P53319 492 aa1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A OYE2Q03558 400 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CWC15Q03772 175 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SPC98P53540 846 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RMD1Q03441 430 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A WRS1Q12109 432 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ALG7P07286 448 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TUB1P09733 447 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A CDC20P26309 610 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A MVD1P32377 396 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A MXR1P40029 184 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A NPC2Q12408 173 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A TOM70P07213 617 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SPE1P08432 466 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ERG4P25340 473 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ARE1P25628 610 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A SSL2Q00578 843 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A RKM2Q03942 479 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A OMS1Q06668 471 aa1.1□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ACM1Q08981 209 aa1.1□□□□□ -2.23
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