RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C ACE2P21192 770 aa4.34□□□□□ -1.71
CSE4YKL049C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CSE4YKL049C NIT1P40447 199 aa4.34□□□□□ -1.71
CSE4YKL049C RRT14P40470 206 aa4.34□□□□□ -1.71
CSE4YKL049C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C RNQ1P25367 405 aa4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C GRX1P25373 110 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C TSA1P34760 196 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C PBY1P38254 753 aa4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C CDA2Q06703 312 aa4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YOR352WQ08816 343 aa4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C CMP2P14747 604 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C APL1P27351 700 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C STE5P32917 917 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YBR184WP38299 523 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C IRR1P40541 1150 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C HFM1P51979 1187 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C HRQ1Q05549 1077 aa4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YKL151CP36059 337 aa4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SAH1P39954 449 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data4.31□□□□□ -1.72not detected
CSE4YKL049C SRP1Q02821 542 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SIZ1Q04195 904 aa4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SGD1Q06132 899 aa4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YDR306CQ06640 478 aa4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C MDM38Q08179 573 aa4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YLL058WQ12198 575 aa4.31□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C GAL10P04397 699 aa4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C PRP9P19736 530 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C PPH3P32345 308 aa4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C CDC12P32468 407 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C AIM3P38266 947 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C TAT2P38967 592 aa4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YJL049WP47048 450 aa4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C MTC3P53077 123 aa4.3□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data4.3□□□□□ -1.72not detected
CSE4YKL049C RAD4P14736 754 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SRM1P21827 482 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C LAM1P38851 1228 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C TPO2P53283 614 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C MSC2Q03455 724 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C ROT1Q03691 256 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C FMP25Q08023 583 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C OSW2Q12202 724 aa4.29□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SOD2P00447 233 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C RPS13P05756 151 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C PRP6P19735 899 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C GIC1P38785 314 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C YAP1801P38856 637 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C PFD1P46988 109 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C TIM54P47045 478 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C NNF1P47149 201 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C RIM8P53179 542 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C ERP6P53198 216 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SRT1Q03175 343 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C SPO75Q07798 868 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C XYL2Q07993 356 aa4.28□□□□□ -1.72
CSE4YKL049C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C FUN30P31380 1131 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C UBP5P39944 805 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ALR2P43553 858 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C GCN5Q03330 439 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C PLB2Q03674 706 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C YDR132CQ03900 495 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C EAF1Q06337 982 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C YPL277CQ08989 487 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C OSH2Q12451 1283 aa4.27□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ADE8P04161 214 aa4.26□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C MEF2P39677 819 aa4.26□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C SPT20P50875 604 aa4.26□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C UTP8P53276 713 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ENA1P13587 1091 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ARE1P25628 610 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C HBS1P32769 611 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C THI80P35202 319 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C YRO2P38079 344 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C CCC2P38995 1004 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C SIT1P39980 628 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C NPP2P39997 493 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ZRG8P40021 1076 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C YER158CP40095 573 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C MND2P40577 368 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C PBP1P53297 722 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ENA2Q01896 1091 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C UBX5Q06682 500 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C ENA5Q12691 1091 aa4.25□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C HSP60P19882 572 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C CDC11P32458 415 aa4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C SCT1P32784 759 aa4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C SRP101P32916 621 aa4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C TOD6P34219 525 aa4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CSE4YKL049C GYP7P48365 746 aa4.24□□□□□ -1.73
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