RNA–Protein interactions for RNA: YHR066W

SSF1, Transcript of Constituent of 66S pre-ribosomal particles, yeast

Gene SSF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSF1	YHR066W	BI4	P03879	638 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	YKL151C	P36059	337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	YBR184W	P38299	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	MTC3	P53077	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
SSF1	YHR066W	ATG13	Q06628	738 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	SVS1	Q12254	260 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	ACE2	P21192	770 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	MRP8	P35719	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	PFD1	P46988	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	RFC5	P38251	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	PBY1	P38254	753 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	IRR1	P40541	1150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	SRM1	P21827	482 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	RRT14	P40470	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
SSF1	YHR066W	HFM1	P51979	1187 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	FMP25	Q08023	583 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	RAD4	P14736	754 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	MRPL22	P53881	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	XYL2	Q07993	356 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	MDM38	Q08179	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	APL1	P27351	700 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	NPP2	P39997	493 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	NNF1	P47149	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	ENV11	P53246	860 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	RSM24	Q03976	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	CMP2	P14747	604 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	OCA5	P38738	679 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	GIC1	P38785	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	IOC3	P43596	787 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YJL049W	P47048	450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SNO2	P53823	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SRT1	Q03175	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	PLB2	Q03674	706 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	GAL10	P04397	699 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	AFR1	P33304	620 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	HUL5	P53119	910 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	MSC2	Q03455	724 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
SSF1	YHR066W	NPP1	P25353	742 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	LAM1	P38851	1228 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YAP1801	P38856	637 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	ALR2	P43553	858 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	TIM54	P47045	478 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	ROT1	Q03691	256 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SGD1	Q06132	899 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	UBX5	Q06682	500 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	BDF2	Q07442	638 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SPO75	Q07798	868 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	FUN30	P31380	1131 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	PPH3	P32345	308 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	ERT1	P38140	529 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	MEF2	P39677	819 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SIT1	P39980	628 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	ERP6	P53198	216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	SFB2	P53953	876 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	NSE3	Q05541	303 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	EAF1	Q06337	982 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	OSW2	Q12202	724 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SSF1	YHR066W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	GYP7	P48365	746 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	DUS4	Q06063	367 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	FLC1	Q08967	793 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	CIT1	P00890	479 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SSF1	YHR066W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77

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