RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data6.73□□□□□ -1.33not detected
VHS1YDR247W PAN5P38787 379 aa6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YIR007WP40566 764 aa6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W HNT2P49775 206 aa6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YNR063WP53749 607 aa6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W SLP1Q12232 587 aa6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YLL054CQ12244 843 aa6.73□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W RAV1P47104 1357 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W TSR4P25040 408 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W AFG2P32794 780 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W TAF5P38129 798 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W ALR2P43553 858 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W UBX5Q06682 500 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W RTC1Q08281 1341 aa6.72□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W PDC5P16467 563 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W ALG3P38179 458 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W ACO2P39533 789 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W MBP1P39678 833 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W MPH1P40562 993 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YJR142WP47173 342 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YGL081WP53156 320 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YPL062WQ02781 134 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W TAF8Q03750 510 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W GIS4Q04233 774 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W LAP2Q10740 671 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W YPL066WQ12194 479 aa6.71□□□□□ -1.33
VHS1YDR247W NAR1P23503 491 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W RGD1P38339 666 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W YAR028WP39548 234 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W TED1P40533 473 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W SPO74P45819 413 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W KIP3P53086 805 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W YMR074CQ04773 145 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W PTC5Q12511 572 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W PDR11P40550 1411 aa6.7□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W SAC7P17121 654 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W IME2P32581 645 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W AVO1Q08236 1176 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W ELG1Q12050 791 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W BNR1P40450 1375 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W MLS1P30952 554 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W SCT1P32784 759 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W ALG14P38242 237 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W HSE1P38753 452 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W VPS53P47061 822 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W RTA1P53047 317 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W CAF120P53836 1060 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W CDC45Q08032 650 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W GNT1Q12096 491 aa6.69□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W DOP1Q03921 1698 aa6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W DRS2P39524 1355 aa6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W RPP0P05317 312 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W CAB3P36076 571 aa6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W ESL2P36168 1195 aa6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W VPS27P40343 622 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W TPO2P53283 614 aa6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W MSH2P25847 964 aa6.67□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W PGM2P37012 569 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W CCC2P38995 1004 aa6.67□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W ERS1P17261 260 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W SRM1P21827 482 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W CDC11P32458 415 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W MAE1P36013 669 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W BET3P36149 193 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W OPY1P38271 328 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W YGR045CP53229 120 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.66□□□□□ -1.34not detected
VHS1YDR247W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.66□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W VMR1P38735 1592 aa6.65□□□□□ -1.34
VHS1YDR247W NUP192P47054 1683 aa6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W CLC1P17891 233 aa6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W NFS1P25374 497 aa6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W GRX4P32642 244 aa6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W SIP5P40210 489 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W NTG2Q08214 380 aa6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YPL260WQ08977 551 aa6.65□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W SSB1P11484 613 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W HBS1P32769 611 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W TOM20P35180 183 aa6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W SSB2P40150 613 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W DNM1P54861 757 aa6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YDR306CQ06640 478 aa6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W HBN1Q96VH4 193 aa6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W NHA1Q99271 985 aa6.64□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W EBP2P36049 427 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W QNS1P38795 714 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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