RNA–Protein interactions for RNA: YBL003C

HTA2, Transcript of Histone H2A, yeast

Gene HTA2, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTA2	YBL003C	VID27	P40157	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MPH1	P40562	993 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
HTA2	YBL003C	SPC105	P53148	917 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	AOS1	Q06624	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GNT1	Q12096	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MPD2	Q99316	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PIF1	P07271	859 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SRD1	P09007	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	AEP2	P22136	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SSH4	P32343	579 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PPH3	P32345	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	AIM21	P40563	679 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	FET4	P40988	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	LEM3	P42838	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YJR124C	P47159	448 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MET13	P53128	600 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YGR035C	P53222	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MET14	Q02196	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	LCD1	Q04377	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	LAP2	Q10740	671 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GAL1	P04385	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	CDC9	P04819	755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SFL1	P20134	766 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	HSP78	P33416	811 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	NIC96	P34077	839 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	CKB2	P38930	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SLS1	P42900	643 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	CAF16	P43569	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YJL181W	P46987	611 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GUP1	P53154	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	HPF1	Q05164	967 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SOG2	Q08817	791 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	RAD18	P10862	487 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	FPS1	P23900	669 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PCL2	P25693	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MLS1	P30952	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	TFC4	P33339	1025 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SPC29	P33419	253 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YKL222C	P35995	705 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YRO2	P38079	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	NEM1	P38757	446 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	EMP65	P40085	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	DAM1	P53267	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YNL034W	P53963	612 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YNL018C	P53976	612 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MLC2	Q06580	163 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	GUD1	Q07729	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PTC5	Q12511	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	IDI1	P15496	288 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	JNM1	P36224	373 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	ALG3	P38179	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	HSE1	P38753	452 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	LSB6	P42951	607 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	TAF1	P46677	1066 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	VPS53	P47061	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YJR096W	P47137	282 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YNR063W	P53749	607 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MEC3	Q02574	474 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YIG1	Q08956	461 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	DID4	P36108	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	LYS5	P50113	272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HTA2	YBL003C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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