RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194894.3

Ankrd39-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Unc5clQ6R653 518 aa22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Col4a1P02463 1669 aa22.84■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nkx1-1G3UXB3 402 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dusp27Q148W8 1138 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PdgfdQ925I7 370 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa22.83■■□□□ 1.25
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 MetP16056 1379 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NpcdF8VQB8 469 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa22.82■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dpf1Q9QX66 387 aa22.81■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Stk31Q99MW1 1018 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zfp646Q6NV66 1788 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa22.8■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ambra1A2AH22 1300 aa22.79■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prr5lA2AVJ5 370 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Arid3aQ62431 601 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Irx6Q9ER75 438 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Col5a2Q3U962 1497 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ClspnQ80YR7 1315 aa22.78■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fbxo33Q8VE08 562 aa22.77■■□□□ 1.24
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ddx60E9PZQ1 1711 aa22.77■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm12185Q5NCB2 835 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cabp2Q9JLK4 216 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Usp19Q3UJD6 1360 aa22.76■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Snai1Q02085 264 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cdca7Q9D0M2 382 aa22.75■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Micall1Q8BGT6 870 aa22.74■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mylk2Q8VCR8 613 aa22.74■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa22.73■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Usp48Q3V0C5 1052 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Esco1Q69Z69 843 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ptf1aQ9QX98 324 aa22.72■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lama4P97927 1816 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Btbd11Q6GQW0 1109 aa22.71■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Usp34Q6ZQ93 3582 aa22.7■■□□□ 1.23
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Olfr247E9PVJ7 320 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Olfr819K7N727 320 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slf2Q6P9P0 1278 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Abcc12Q80WJ6 1366 aa22.7■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fam83gQ5SWY7 812 aa22.69■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc4a9E9PUP3 929 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cnnm1Q0GA42 951 aa22.68■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 VegfbP49766 207 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tsen2Q6P7W5 460 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 St5Q924W7 1134 aa22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nup188Q6ZQH8 1759 aa22.66■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa22.66■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Plekhg5Q66T02 1073 aa22.66■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.66■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa22.66■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mical3Q8CJ19 1993 aa22.65■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Trpm7Q923J1 1863 aa22.64■■□□□ 1.22
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa22.64■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prkab2Q6PAM0 271 aa22.64■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Plagl1Q9JLQ4 704 aa22.64■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ifit1bl2Q3U687 466 aa22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slc39a6Q8C145 765 aa22.62■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Flad1Q8R123 492 aa22.62■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Glis2Q8VDL9 521 aa22.62■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Scn9aQ62205 1984 aa22.61■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zfp831A2ADM8 1628 aa22.61■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dok7Q18PE0 504 aa22.61■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mrc1Q61830 1456 aa22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 CltaO08585 235 aa22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nlgn2Q69ZK9 836 aa22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 SowahdQ8BY98 327 aa22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dbndd1Q9CZ00 160 aa22.6■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Stox1B2RQL2 990 aa22.59■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Csf1rP09581 977 aa22.59■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Soga3Q6NZL0 945 aa22.59■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Myo5bP21271 1818 aa22.59■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Bcl2l13P59017 434 aa22.58■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa22.58■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.58■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 TefQ9JLC6 301 aa22.58■■□□□ 1.21
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Iqsec3Q3TES0 1195 aa22.57■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adam1aQ60813 791 aa22.57■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dcdc2bF7BCK0 340 aa22.56■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Iqcf3Q9D498 203 aa22.56■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pde4bB1AWC9 736 aa22.55■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dctn1O08788 1281 aa22.55■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prim1P20664 417 aa22.55■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prr29B1ARI9 187 aa22.54■■□□□ 1.2
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Vil1Q62468 827 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.2 ms