Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,89■■■■■ 5,42
Pde4bB1AWC9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,31■■■■■ 4,84
Pde4bB1AWC9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,7■■■■■ 4,75
Pde4bB1AWC9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42,48■■■■■ 4,39
Pde4bB1AWC9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,46■■■■■ 4,39
Pde4bB1AWC9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41,46■■■■■ 4,23
Pde4bB1AWC9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Pde4bB1AWC9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Pde4bB1AWC9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Pde4bB1AWC9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,81■■■■■ 4,12
Pde4bB1AWC9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Pde4bB1AWC9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Pde4bB1AWC9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Pde4bB1AWC9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,72■■■■□ 3,95
Pde4bB1AWC9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Pde4bB1AWC9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Pde4bB1AWC9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Pde4bB1AWC9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Pde4bB1AWC9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,27■■■■□ 3,88
Pde4bB1AWC9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Pde4bB1AWC9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Pde4bB1AWC9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Pde4bB1AWC9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Pde4bB1AWC9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Pde4bB1AWC9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Pde4bB1AWC9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Pde4bB1AWC9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,69■■■■□ 3,78
Pde4bB1AWC9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
Pde4bB1AWC9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Pde4bB1AWC9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Pde4bB1AWC9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Pde4bB1AWC9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Pde4bB1AWC9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,95■■■■□ 3,66
Pde4bB1AWC9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Pde4bB1AWC9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
Pde4bB1AWC9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Pde4bB1AWC9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Pde4bB1AWC9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,57■■■■□ 3,6
Pde4bB1AWC9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Pde4bB1AWC9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Pde4bB1AWC9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,58
Pde4bB1AWC9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,43■■■■□ 3,58
Pde4bB1AWC9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,21■■■■□ 3,55
Pde4bB1AWC9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,17■■■■□ 3,54
Pde4bB1AWC9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Pde4bB1AWC9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Pde4bB1AWC9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,09■■■■□ 3,53
Pde4bB1AWC9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Pde4bB1AWC9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Pde4bB1AWC9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Pde4bB1AWC9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,68■■■■□ 3,46
Pde4bB1AWC9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Pde4bB1AWC9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Pde4bB1AWC9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Pde4bB1AWC9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Pde4bB1AWC9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Pde4bB1AWC9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Pde4bB1AWC9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Pde4bB1AWC9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Pde4bB1AWC9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Pde4bB1AWC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Pde4bB1AWC9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Pde4bB1AWC9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Pde4bB1AWC9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Pde4bB1AWC9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Pde4bB1AWC9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Pde4bB1AWC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Pde4bB1AWC9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Pde4bB1AWC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Pde4bB1AWC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,12■■■■□ 3,37
Pde4bB1AWC9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Pde4bB1AWC9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Pde4bB1AWC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Pde4bB1AWC9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Pde4bB1AWC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Pde4bB1AWC9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Pde4bB1AWC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Pde4bB1AWC9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Pde4bB1AWC9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Pde4bB1AWC9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Pde4bB1AWC9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Pde4bB1AWC9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Pde4bB1AWC9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Pde4bB1AWC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Pde4bB1AWC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Pde4bB1AWC9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Pde4bB1AWC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,51■■■■□ 3,28
Pde4bB1AWC9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Pde4bB1AWC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Pde4bB1AWC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Pde4bB1AWC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Pde4bB1AWC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Pde4bB1AWC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Pde4bB1AWC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Pde4bB1AWC9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Pde4bB1AWC9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Pde4bB1AWC9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Pde4bB1AWC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Pde4bB1AWC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Pde4bB1AWC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
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