Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
Fhdc1Q3ULZ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Fhdc1Q3ULZ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Fhdc1Q3ULZ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fhdc1Q3ULZ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Fhdc1Q3ULZ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Fhdc1Q3ULZ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Fhdc1Q3ULZ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Fhdc1Q3ULZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Fhdc1Q3ULZ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Fhdc1Q3ULZ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Fhdc1Q3ULZ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Fhdc1Q3ULZ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Fhdc1Q3ULZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Fhdc1Q3ULZ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Fhdc1Q3ULZ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Fhdc1Q3ULZ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Fhdc1Q3ULZ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Fhdc1Q3ULZ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Fhdc1Q3ULZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Fhdc1Q3ULZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Fhdc1Q3ULZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Fhdc1Q3ULZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Fhdc1Q3ULZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Fhdc1Q3ULZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Fhdc1Q3ULZ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Fhdc1Q3ULZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Fhdc1Q3ULZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Fhdc1Q3ULZ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Fhdc1Q3ULZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Fhdc1Q3ULZ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Fhdc1Q3ULZ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fhdc1Q3ULZ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Fhdc1Q3ULZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fhdc1Q3ULZ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fhdc1Q3ULZ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Fhdc1Q3ULZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fhdc1Q3ULZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Fhdc1Q3ULZ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fhdc1Q3ULZ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fhdc1Q3ULZ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fhdc1Q3ULZ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Fhdc1Q3ULZ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fhdc1Q3ULZ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Fhdc1Q3ULZ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Fhdc1Q3ULZ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Fhdc1Q3ULZ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Fhdc1Q3ULZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
Fhdc1Q3ULZ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Fhdc1Q3ULZ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fhdc1Q3ULZ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fhdc1Q3ULZ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fhdc1Q3ULZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fhdc1Q3ULZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fhdc1Q3ULZ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fhdc1Q3ULZ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fhdc1Q3ULZ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fhdc1Q3ULZ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fhdc1Q3ULZ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fhdc1Q3ULZ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Fhdc1Q3ULZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Fhdc1Q3ULZ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Fhdc1Q3ULZ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fhdc1Q3ULZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fhdc1Q3ULZ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fhdc1Q3ULZ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fhdc1Q3ULZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fhdc1Q3ULZ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Fhdc1Q3ULZ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fhdc1Q3ULZ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fhdc1Q3ULZ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fhdc1Q3ULZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fhdc1Q3ULZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fhdc1Q3ULZ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Fhdc1Q3ULZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fhdc1Q3ULZ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Fhdc1Q3ULZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fhdc1Q3ULZ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fhdc1Q3ULZ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fhdc1Q3ULZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fhdc1Q3ULZ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Fhdc1Q3ULZ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fhdc1Q3ULZ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms