Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,74■■■■■ 5,39
Fhdc1Q3ULZ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,28■■■■■ 4,84
Fhdc1Q3ULZ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,54■■■■■ 4,72
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,48■■■■■ 4,39
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42,15■■■■■ 4,34
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41,21■■■■■ 4,19
Fhdc1Q3ULZ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Fhdc1Q3ULZ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Fhdc1Q3ULZ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Fhdc1Q3ULZ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,6■■■■■ 4,09
Fhdc1Q3ULZ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,77■■■■□ 3,96
Fhdc1Q3ULZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Fhdc1Q3ULZ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,41■■■■□ 3,9
Fhdc1Q3ULZ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Fhdc1Q3ULZ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Fhdc1Q3ULZ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Fhdc1Q3ULZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,86
Fhdc1Q3ULZ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Fhdc1Q3ULZ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Fhdc1Q3ULZ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
Fhdc1Q3ULZ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Fhdc1Q3ULZ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Fhdc1Q3ULZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Fhdc1Q3ULZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,31■■■■□ 3,72
Fhdc1Q3ULZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Fhdc1Q3ULZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,05■■■■□ 3,68
Fhdc1Q3ULZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Fhdc1Q3ULZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Fhdc1Q3ULZ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Fhdc1Q3ULZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Fhdc1Q3ULZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Fhdc1Q3ULZ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Fhdc1Q3ULZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Fhdc1Q3ULZ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Fhdc1Q3ULZ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Fhdc1Q3ULZ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Fhdc1Q3ULZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Fhdc1Q3ULZ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Fhdc1Q3ULZ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,89■■■■□ 3,5
Fhdc1Q3ULZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Fhdc1Q3ULZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Fhdc1Q3ULZ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Fhdc1Q3ULZ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,53■■■■□ 3,44
Fhdc1Q3ULZ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Fhdc1Q3ULZ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,46■■■■□ 3,43
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Fhdc1Q3ULZ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Fhdc1Q3ULZ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Fhdc1Q3ULZ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Fhdc1Q3ULZ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Fhdc1Q3ULZ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Fhdc1Q3ULZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,13■■■■□ 3,38
Fhdc1Q3ULZ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Fhdc1Q3ULZ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Fhdc1Q3ULZ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Fhdc1Q3ULZ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Fhdc1Q3ULZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Fhdc1Q3ULZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Fhdc1Q3ULZ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Fhdc1Q3ULZ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Fhdc1Q3ULZ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Fhdc1Q3ULZ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Fhdc1Q3ULZ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Fhdc1Q3ULZ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Fhdc1Q3ULZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Fhdc1Q3ULZ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Fhdc1Q3ULZ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Fhdc1Q3ULZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Fhdc1Q3ULZ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Fhdc1Q3ULZ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Fhdc1Q3ULZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Fhdc1Q3ULZ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
Fhdc1Q3ULZ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Fhdc1Q3ULZ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Fhdc1Q3ULZ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Fhdc1Q3ULZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Fhdc1Q3ULZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Fhdc1Q3ULZ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,01■■■■□ 3,2
Fhdc1Q3ULZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Fhdc1Q3ULZ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Fhdc1Q3ULZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Fhdc1Q3ULZ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Fhdc1Q3ULZ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Fhdc1Q3ULZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Fhdc1Q3ULZ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Fhdc1Q3ULZ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Fhdc1Q3ULZ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms